More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1492 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  77.04 
 
 
453 aa  723    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  76.6 
 
 
453 aa  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  77.04 
 
 
453 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  99.12 
 
 
454 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  99.12 
 
 
454 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  98.46 
 
 
454 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  98.46 
 
 
454 aa  930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  100 
 
 
454 aa  946    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  76.6 
 
 
453 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  76.38 
 
 
453 aa  717    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  74.39 
 
 
455 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  76.6 
 
 
453 aa  718    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  76.38 
 
 
453 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  76.82 
 
 
453 aa  720    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  77.53 
 
 
445 aa  715    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  67.34 
 
 
458 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  67.34 
 
 
458 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  67.34 
 
 
458 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  67.81 
 
 
452 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  66.96 
 
 
457 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  65.99 
 
 
476 aa  601  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  67.12 
 
 
456 aa  598  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  65.61 
 
 
480 aa  594  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  58.24 
 
 
458 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0453  para-aminobenzoate synthase, component I  53.96 
 
 
452 aa  504  1e-141  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0249447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  59.73 
 
 
467 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  57.33 
 
 
467 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  55.41 
 
 
453 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  57.68 
 
 
467 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  58.77 
 
 
467 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.41 
 
 
466 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  56.84 
 
 
470 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  54.07 
 
 
456 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  57.02 
 
 
471 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  56.84 
 
 
470 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.21 
 
 
470 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  56.84 
 
 
470 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.95 
 
 
469 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  53.6 
 
 
456 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.81 
 
 
467 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  53.03 
 
 
497 aa  461  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.51 
 
 
477 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.54 
 
 
473 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.94 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  50.1 
 
 
509 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.14 
 
 
458 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.2 
 
 
474 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  49.23 
 
 
471 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  48.22 
 
 
460 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  46.19 
 
 
468 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.77 
 
 
448 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.26 
 
 
447 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  45.19 
 
 
476 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  47.32 
 
 
453 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.89 
 
 
466 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  47.22 
 
 
447 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  48.22 
 
 
447 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  52.5 
 
 
408 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.37 
 
 
446 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.4 
 
 
474 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.15 
 
 
446 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.71 
 
 
447 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.76 
 
 
450 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.27 
 
 
447 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  44.87 
 
 
443 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  42.67 
 
 
430 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  42.44 
 
 
430 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.24 
 
 
461 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.64 
 
 
480 aa  353  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  44.64 
 
 
462 aa  352  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.22 
 
 
466 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.99 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  40.22 
 
 
495 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1514  hypothetical protein  38.07 
 
 
440 aa  312  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.69 
 
 
466 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1469  hypothetical protein  37.04 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.51 
 
 
480 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.36 
 
 
465 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  38.05 
 
 
491 aa  296  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.23 
 
 
457 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  35.68 
 
 
465 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.22 
 
 
741 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  37.17 
 
 
491 aa  289  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.2 
 
 
474 aa  289  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.07 
 
 
444 aa  289  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  35.51 
 
 
448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  35.75 
 
 
448 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.33 
 
 
466 aa  286  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1342  anthranilate synthase, component I  36.3 
 
 
499 aa  286  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00981315  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  38.1 
 
 
485 aa  285  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.71 
 
 
449 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.09 
 
 
472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  36.85 
 
 
496 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.59 
 
 
469 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.05 
 
 
460 aa  280  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.34 
 
 
464 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  34.58 
 
 
465 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  34.43 
 
 
465 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  34.58 
 
 
480 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.36 
 
 
721 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>