More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1564 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
469 aa  943    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.57 
 
 
457 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  51 
 
 
480 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.17 
 
 
474 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  44.35 
 
 
495 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  45.95 
 
 
471 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.59 
 
 
466 aa  358  8e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.47 
 
 
465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.86 
 
 
460 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.83 
 
 
464 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.02 
 
 
466 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  47.66 
 
 
468 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.44 
 
 
472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  45.78 
 
 
453 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.36 
 
 
460 aa  331  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.86 
 
 
469 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.98 
 
 
473 aa  331  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.53 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  43.27 
 
 
458 aa  326  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.23 
 
 
452 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  42.64 
 
 
453 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.06 
 
 
472 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.57 
 
 
447 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2036  Anthranilate synthase  42.28 
 
 
478 aa  325  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0992508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.13 
 
 
470 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.27 
 
 
456 aa  323  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1132  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.11 
 
 
474 aa  322  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.11 
 
 
509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.25 
 
 
470 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  41.08 
 
 
456 aa  319  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  39.82 
 
 
448 aa  319  7e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  39.82 
 
 
448 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  42.36 
 
 
496 aa  316  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.49 
 
 
470 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  43.07 
 
 
471 aa  316  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.61 
 
 
466 aa  315  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.7 
 
 
470 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.86 
 
 
450 aa  315  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  41.48 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  43.49 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  47.03 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.54 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  42.63 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.58 
 
 
480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  41.58 
 
 
462 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.48 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2115  anthranilate synthase, component I  44.75 
 
 
509 aa  313  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.332687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.48 
 
 
467 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.11 
 
 
446 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  43.36 
 
 
485 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.52 
 
 
458 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  42.33 
 
 
476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.67 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.26 
 
 
476 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.71 
 
 
457 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.48 
 
 
447 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.06 
 
 
458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  41.21 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.17 
 
 
448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  40.88 
 
 
507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  41.06 
 
 
458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  41.06 
 
 
458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.89 
 
 
477 aa  307  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1342  anthranilate synthase, component I  40.64 
 
 
499 aa  307  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00981315  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.87 
 
 
480 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.57 
 
 
474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  42.23 
 
 
454 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  42.23 
 
 
454 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.44 
 
 
466 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.18 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  40.78 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.59 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  40.56 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  42.03 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  40.78 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  42.38 
 
 
474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.56 
 
 
453 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.56 
 
 
453 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  40.78 
 
 
453 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.53 
 
 
476 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  40.56 
 
 
453 aa  302  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.58 
 
 
490 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2853  anthranilate synthase component I  42.46 
 
 
500 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0906  anthranilate synthase component I  39.46 
 
 
493 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000348371  hitchhiker  0.00000000636534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  40.88 
 
 
445 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  37.85 
 
 
509 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  41.59 
 
 
454 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.3 
 
 
455 aa  299  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  44.12 
 
 
447 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.79 
 
 
721 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  39.96 
 
 
491 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  37.82 
 
 
494 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.23 
 
 
457 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4721  anthranilate synthase, component I  40.17 
 
 
504 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.43 
 
 
467 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  40.26 
 
 
487 aa  296  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  38.69 
 
 
465 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  37.58 
 
 
492 aa  296  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3709  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.17 
 
 
488 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131027  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.72 
 
 
741 aa  296  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>