More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5650 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
672 aa  1327    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  45.06 
 
 
731 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  45.12 
 
 
714 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.67 
 
 
732 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.87 
 
 
762 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.93 
 
 
732 aa  555  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49 
 
 
718 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.33 
 
 
700 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2111  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.14 
 
 
687 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0378177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  47.47 
 
 
703 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  43.9 
 
 
705 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1044  para-aminobenzoate synthase, component I  43.38 
 
 
704 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.869303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  47.27 
 
 
686 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3391  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.48 
 
 
637 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42151  predicted protein  40.85 
 
 
760 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.062393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  47.31 
 
 
682 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1828  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.88 
 
 
518 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.31 
 
 
721 aa  350  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.28 
 
 
719 aa  347  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74393  para-aminobenzoate synthase, (PABA)  30.42 
 
 
769 aa  299  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.57 
 
 
466 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06550  para aminobenzoic acid synthetase (Eurofung)  30.36 
 
 
823 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0798538  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.22 
 
 
446 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.2 
 
 
466 aa  259  8e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  39.44 
 
 
453 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.86 
 
 
471 aa  259  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.69 
 
 
461 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.79 
 
 
446 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  36.12 
 
 
495 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.01 
 
 
447 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  38.75 
 
 
443 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.73 
 
 
450 aa  251  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.13 
 
 
447 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.71 
 
 
480 aa  249  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  38.71 
 
 
462 aa  248  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.4 
 
 
493 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  38.99 
 
 
468 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.96 
 
 
460 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.81 
 
 
455 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.06 
 
 
480 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.13 
 
 
447 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  34.2 
 
 
448 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  34.86 
 
 
448 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  34.85 
 
 
456 aa  241  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.09 
 
 
482 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1785  anthranilate synthase  33.76 
 
 
505 aa  240  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.33 
 
 
470 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  33.4 
 
 
471 aa  239  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  38.78 
 
 
447 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.97 
 
 
470 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.7 
 
 
466 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.14 
 
 
448 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  38.89 
 
 
454 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  40.33 
 
 
453 aa  238  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.43 
 
 
466 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  37.88 
 
 
430 aa  237  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.06 
 
 
453 aa  236  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.06 
 
 
453 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  38.52 
 
 
453 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  37.16 
 
 
453 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.91 
 
 
469 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.03 
 
 
469 aa  236  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  37.16 
 
 
453 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.12 
 
 
470 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.57 
 
 
480 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.61 
 
 
454 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.42 
 
 
449 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  40.06 
 
 
453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  40.11 
 
 
445 aa  235  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  37.07 
 
 
453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.15 
 
 
470 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.05 
 
 
467 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  37.6 
 
 
430 aa  233  6e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.61 
 
 
454 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.61 
 
 
454 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  39.78 
 
 
453 aa  233  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1342  anthranilate synthase, component I  38.18 
 
 
499 aa  233  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00981315  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.61 
 
 
454 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  41.9 
 
 
408 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  36.47 
 
 
491 aa  232  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.14 
 
 
490 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0533  anthranilate synthase component I  34.23 
 
 
497 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  33.26 
 
 
458 aa  230  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2860  anthranilate synthase component I  35.04 
 
 
497 aa  230  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167727  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3583  anthranilate synthase component I  34.23 
 
 
522 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3575  anthranilate synthase component I  34.23 
 
 
522 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889198  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1910  anthranilate synthase component I  34.23 
 
 
522 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  36.26 
 
 
487 aa  230  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0644  anthranilate synthase component I  34.23 
 
 
522 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0940  anthranilate synthase component I  34.23 
 
 
522 aa  230  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  34 
 
 
467 aa  230  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.46 
 
 
464 aa  230  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.75 
 
 
509 aa  230  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3556  anthranilate synthase component I  34.23 
 
 
522 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.58 
 
 
474 aa  229  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0463  anthranilate synthase component I  34.68 
 
 
497 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612638  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0439  anthranilate synthase component I  34.68 
 
 
497 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.629503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0715  hypothetical protein  35.27 
 
 
453 aa  229  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0153032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.85 
 
 
458 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  33.69 
 
 
467 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>