More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1201 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1201  Chorismate binding  100 
 
 
417 aa  860    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  0.539184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2137  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  49.76 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.28 
 
 
435 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09868  para-aminobenzoate synthase, component I  48.57 
 
 
430 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7048  Chorismate binding-like protein  45.87 
 
 
412 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1808  p-aminobenzoate synthetase, component I  43.69 
 
 
429 aa  333  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000581236  normal  0.854034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.54 
 
 
466 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.82 
 
 
471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  37.27 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.36 
 
 
467 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.75 
 
 
447 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  37.25 
 
 
447 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  32.39 
 
 
460 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  35.9 
 
 
458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  35.9 
 
 
458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.9 
 
 
458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.29 
 
 
470 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.78 
 
 
456 aa  217  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.62 
 
 
469 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.64 
 
 
467 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.69 
 
 
480 aa  216  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  35.48 
 
 
453 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  34.65 
 
 
453 aa  216  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  36.62 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.29 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  30.96 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  37.25 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  30.96 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.72 
 
 
470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  30.96 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  36.59 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.29 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.47 
 
 
629 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.8 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.44 
 
 
592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  32.34 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  33.74 
 
 
456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  30.96 
 
 
453 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.73 
 
 
453 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.73 
 
 
453 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  32.34 
 
 
454 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  32.34 
 
 
454 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  30.89 
 
 
453 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  35.48 
 
 
408 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  31.15 
 
 
445 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.85 
 
 
466 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  32.11 
 
 
454 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.85 
 
 
447 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.36 
 
 
466 aa  209  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  32.11 
 
 
454 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.69 
 
 
466 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  39.34 
 
 
468 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  34.49 
 
 
497 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.05 
 
 
741 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.21 
 
 
601 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.64 
 
 
672 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.83 
 
 
447 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.07 
 
 
446 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  36.21 
 
 
456 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  38.85 
 
 
430 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3258  anthranilate synthase component I-like protein  32.6 
 
 
511 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3709  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.7 
 
 
488 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131027  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.08 
 
 
446 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  38.73 
 
 
430 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.42 
 
 
473 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.77 
 
 
509 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  34.25 
 
 
443 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  41.24 
 
 
612 aa  203  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.45 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  35.81 
 
 
705 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  32.03 
 
 
471 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  36.64 
 
 
731 aa  202  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  32.13 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  32.68 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  32.68 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  32.68 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  32.68 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  30.53 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.75 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  35.2 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  32.68 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  32.21 
 
 
480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  31.09 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.69 
 
 
476 aa  200  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  34.44 
 
 
447 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.96 
 
 
493 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.55 
 
 
467 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.97 
 
 
466 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.18 
 
 
574 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.97 
 
 
472 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  37.67 
 
 
509 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  35.59 
 
 
448 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0453  para-aminobenzoate synthase, component I  36.54 
 
 
452 aa  199  9e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0249447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.45 
 
 
434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.77 
 
 
586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.99 
 
 
732 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  32.49 
 
 
455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.29 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.3 
 
 
482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0690  Anthranilate synthase  31.23 
 
 
465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>