More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4379 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  90.71 
 
 
466 aa  796    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  77.07 
 
 
457 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
472 aa  938    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  90.06 
 
 
472 aa  793    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  69.93 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  68.2 
 
 
460 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.76 
 
 
457 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.88 
 
 
476 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.73 
 
 
474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  48.77 
 
 
466 aa  356  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.99 
 
 
480 aa  342  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.89 
 
 
471 aa  342  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.24 
 
 
465 aa  330  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.44 
 
 
469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  42.61 
 
 
495 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.96 
 
 
466 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.74 
 
 
460 aa  317  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  44.34 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.81 
 
 
448 aa  313  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  39.13 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2036  Anthranilate synthase  40.64 
 
 
478 aa  299  8e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0992508  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  40.09 
 
 
456 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  38.96 
 
 
514 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  41.15 
 
 
496 aa  295  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.27 
 
 
480 aa  293  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  43.9 
 
 
462 aa  292  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.87 
 
 
455 aa  292  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  40.84 
 
 
453 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.58 
 
 
452 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1132  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.68 
 
 
474 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2115  anthranilate synthase, component I  41.83 
 
 
509 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.332687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.6 
 
 
458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  38.82 
 
 
448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  39.06 
 
 
448 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.92 
 
 
450 aa  286  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  41.43 
 
 
447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.99 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.32 
 
 
480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  39.24 
 
 
491 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  41.96 
 
 
491 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  41.31 
 
 
491 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  38.44 
 
 
453 aa  282  9e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  37.56 
 
 
453 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  43.85 
 
 
408 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  39.33 
 
 
458 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.36 
 
 
453 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.36 
 
 
453 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.59 
 
 
509 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  38.36 
 
 
453 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  38.36 
 
 
453 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.89 
 
 
490 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  38.36 
 
 
453 aa  279  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.84 
 
 
476 aa  279  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.56 
 
 
454 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  39.32 
 
 
471 aa  279  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.24 
 
 
741 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  38.14 
 
 
453 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.06 
 
 
454 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  38.14 
 
 
453 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  39.66 
 
 
447 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.15 
 
 
466 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  36.07 
 
 
465 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  38.83 
 
 
445 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.03 
 
 
470 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  38.89 
 
 
454 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  38.48 
 
 
485 aa  276  8e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  37.07 
 
 
465 aa  276  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.78 
 
 
470 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  37.02 
 
 
507 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.84 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.84 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.19 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.86 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  37.42 
 
 
503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.31 
 
 
447 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.16 
 
 
467 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.55 
 
 
467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.81 
 
 
470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40 
 
 
467 aa  272  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4721  anthranilate synthase, component I  37.93 
 
 
504 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.48 
 
 
446 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.43 
 
 
467 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.17 
 
 
721 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  36.89 
 
 
430 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.78 
 
 
493 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.19 
 
 
470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  37 
 
 
430 aa  270  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  41.16 
 
 
474 aa  270  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.14 
 
 
473 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  37.58 
 
 
494 aa  269  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.26 
 
 
446 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.98 
 
 
469 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.81 
 
 
458 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  40.81 
 
 
458 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  40.81 
 
 
458 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.91 
 
 
477 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  36.91 
 
 
487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.94 
 
 
482 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  40.21 
 
 
467 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  38.66 
 
 
471 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.256099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>