More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1132 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1132  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  100 
 
 
474 aa  921    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  58.97 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.91 
 
 
465 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.06 
 
 
457 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.45 
 
 
469 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.47 
 
 
472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.51 
 
 
464 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.12 
 
 
472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.33 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.54 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.14 
 
 
480 aa  319  7e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.4 
 
 
460 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.3 
 
 
466 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.4 
 
 
466 aa  315  9e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  41.16 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.28 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.58 
 
 
471 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1898  Chorismate binding-like protein  45.15 
 
 
464 aa  307  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0230156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  42.83 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2603  anthranilate synthase  46.87 
 
 
432 aa  298  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0445726  normal  0.0808647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.78 
 
 
490 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.83 
 
 
452 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  41.05 
 
 
453 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.94 
 
 
469 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.88 
 
 
446 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2239  anthranilate synthase  45.63 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.67 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.59 
 
 
458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.99 
 
 
721 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  39.59 
 
 
458 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  39.59 
 
 
458 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.45 
 
 
460 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.55 
 
 
476 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.92 
 
 
480 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  45.03 
 
 
408 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  40.92 
 
 
462 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.03 
 
 
470 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.04 
 
 
467 aa  279  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21661  putative p-aminobenzoate synthetase  41.6 
 
 
446 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.145928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.18 
 
 
480 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.16 
 
 
458 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.54 
 
 
447 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1294  putative p-aminobenzoate synthetase  41.6 
 
 
446 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.6 
 
 
466 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.25 
 
 
470 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.09 
 
 
447 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.71 
 
 
447 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.58 
 
 
467 aa  276  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3570  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.78 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.41 
 
 
477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  37.39 
 
 
467 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.32 
 
 
509 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2036  Anthranilate synthase  39.78 
 
 
478 aa  273  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0992508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  39.96 
 
 
447 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  40.98 
 
 
447 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.81 
 
 
467 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.55 
 
 
470 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  37.56 
 
 
453 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.34 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.88 
 
 
474 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.42 
 
 
448 aa  269  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.61 
 
 
456 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1342  anthranilate synthase, component I  37.58 
 
 
499 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00981315  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.19 
 
 
473 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  33.71 
 
 
448 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.96 
 
 
474 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  38.02 
 
 
458 aa  266  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.5 
 
 
455 aa  265  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  39.52 
 
 
496 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.67 
 
 
467 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  36.19 
 
 
456 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29681  putative p-aminobenzoate synthetase  39.95 
 
 
471 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.64 
 
 
466 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  34.45 
 
 
448 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.43 
 
 
493 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.3 
 
 
461 aa  262  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18251  putative p-aminobenzoate synthetase  40.43 
 
 
442 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.240913  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  39.75 
 
 
443 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  37.96 
 
 
454 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  38.79 
 
 
497 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.2 
 
 
454 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.13 
 
 
450 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  34.53 
 
 
456 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  37.47 
 
 
453 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  37.96 
 
 
454 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  37.47 
 
 
453 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  37.96 
 
 
454 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  37.96 
 
 
454 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  37.47 
 
 
453 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  40 
 
 
686 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  37.25 
 
 
453 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  35.41 
 
 
509 aa  256  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  33.48 
 
 
430 aa  256  7e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  33.48 
 
 
430 aa  256  8e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.02 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.51 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.02 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  37.7 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  36.51 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  34.5 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>