More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1978 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
474 aa  988    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  50.1 
 
 
458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  52.3 
 
 
456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  52.15 
 
 
453 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.1 
 
 
452 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.44 
 
 
466 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.79 
 
 
470 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.91 
 
 
456 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.9 
 
 
470 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.12 
 
 
470 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.13 
 
 
467 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  50 
 
 
467 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  50.64 
 
 
497 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.79 
 
 
470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.78 
 
 
476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.33 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49 
 
 
467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  49.78 
 
 
467 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  50 
 
 
453 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.38 
 
 
480 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.87 
 
 
477 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  50.11 
 
 
453 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  50 
 
 
453 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.78 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  50 
 
 
453 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.78 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  49.89 
 
 
456 aa  438  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  51.24 
 
 
455 aa  438  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  50 
 
 
471 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  50 
 
 
453 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  49.78 
 
 
453 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  49.66 
 
 
445 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.77 
 
 
469 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.55 
 
 
490 aa  428  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  48.62 
 
 
454 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.9 
 
 
467 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  48.41 
 
 
454 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  49.66 
 
 
458 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.66 
 
 
458 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  49.66 
 
 
458 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  48.2 
 
 
454 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  48.2 
 
 
454 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  48.2 
 
 
454 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.56 
 
 
473 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  46.95 
 
 
509 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.45 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0453  para-aminobenzoate synthase, component I  45.09 
 
 
452 aa  402  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0249447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  48.07 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.64 
 
 
460 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  47.52 
 
 
447 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.47 
 
 
471 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  44.64 
 
 
476 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  45.33 
 
 
447 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.18 
 
 
461 aa  359  8e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  45.43 
 
 
453 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  50.54 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.99 
 
 
474 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.22 
 
 
447 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.76 
 
 
480 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  41.76 
 
 
462 aa  351  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  42.44 
 
 
430 aa  350  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  42.44 
 
 
430 aa  350  4e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.22 
 
 
446 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.99 
 
 
446 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.08 
 
 
447 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.41 
 
 
450 aa  345  7e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.54 
 
 
447 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.79 
 
 
466 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  44.12 
 
 
443 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.63 
 
 
448 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.91 
 
 
444 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  39.73 
 
 
448 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.44 
 
 
457 aa  292  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  39.5 
 
 
448 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1514  hypothetical protein  38.34 
 
 
440 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.26 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.82 
 
 
480 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.84 
 
 
469 aa  286  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1469  hypothetical protein  37.47 
 
 
440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  37.01 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.01 
 
 
474 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.36 
 
 
466 aa  283  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.18 
 
 
466 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.92 
 
 
465 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.03 
 
 
464 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.82 
 
 
721 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  34.1 
 
 
517 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.62 
 
 
509 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.93 
 
 
460 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  34.38 
 
 
514 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.58 
 
 
476 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  35.48 
 
 
465 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  34.38 
 
 
489 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.51 
 
 
472 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.73 
 
 
466 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.68 
 
 
457 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2036  Anthranilate synthase  34.08 
 
 
478 aa  256  8e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0992508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  32.33 
 
 
496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.36 
 
 
741 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.33 
 
 
472 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>