More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2398 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
457 aa  919    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.17 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.64 
 
 
472 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.63 
 
 
460 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.22 
 
 
469 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.59 
 
 
457 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.88 
 
 
472 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.88 
 
 
466 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.95 
 
 
476 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  48.9 
 
 
495 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.76 
 
 
474 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.48 
 
 
465 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.66 
 
 
466 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  48.58 
 
 
480 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.94 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.2 
 
 
471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  46.83 
 
 
468 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.15 
 
 
460 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2036  Anthranilate synthase  47.14 
 
 
478 aa  342  9e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0992508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  44.39 
 
 
448 aa  326  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  44.84 
 
 
448 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1132  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.62 
 
 
474 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  42.12 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.89 
 
 
454 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.89 
 
 
454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.89 
 
 
454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  41.89 
 
 
454 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.99 
 
 
452 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  46.74 
 
 
453 aa  315  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.38 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.56 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.11 
 
 
470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  44.74 
 
 
462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.7 
 
 
467 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.52 
 
 
480 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  41.61 
 
 
485 aa  312  7.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.58 
 
 
467 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.59 
 
 
467 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  46.7 
 
 
467 aa  310  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.82 
 
 
470 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.75 
 
 
448 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  41.82 
 
 
453 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  41.82 
 
 
453 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.99 
 
 
458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.77 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  41.5 
 
 
453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.7 
 
 
741 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.22 
 
 
458 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  41.59 
 
 
453 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  45.22 
 
 
458 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  45.22 
 
 
458 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.31 
 
 
453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.31 
 
 
453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  44.27 
 
 
443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  41.88 
 
 
445 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  41.59 
 
 
453 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.04 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  41.43 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  42.18 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  40.22 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.55 
 
 
450 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  40.36 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  41.36 
 
 
453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  40.72 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  38.97 
 
 
456 aa  302  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  41.71 
 
 
465 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.5 
 
 
476 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.62 
 
 
509 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.5 
 
 
467 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.89 
 
 
446 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.91 
 
 
455 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  42.57 
 
 
447 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  40.09 
 
 
465 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.28 
 
 
480 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.77 
 
 
480 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.74 
 
 
456 aa  296  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  46.22 
 
 
471 aa  296  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  43.36 
 
 
453 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.67 
 
 
446 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  40.82 
 
 
487 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  39.64 
 
 
465 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  40.22 
 
 
465 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  40.22 
 
 
465 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.57 
 
 
457 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.95 
 
 
447 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  40.22 
 
 
465 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.86 
 
 
447 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.43 
 
 
721 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  40.22 
 
 
465 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.87 
 
 
477 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  39.87 
 
 
465 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  40.74 
 
 
465 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  40.09 
 
 
465 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.44 
 
 
474 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.38 
 
 
469 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  39.87 
 
 
480 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.79 
 
 
466 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.52 
 
 
447 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.57 
 
 
482 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  39.55 
 
 
430 aa  289  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>