More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0053 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  82.14 
 
 
460 aa  707    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
464 aa  923    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  70.87 
 
 
466 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  70.65 
 
 
472 aa  598  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  69.57 
 
 
472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  70.96 
 
 
457 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.17 
 
 
457 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.7 
 
 
476 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.13 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.06 
 
 
480 aa  354  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.58 
 
 
474 aa  349  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  42.71 
 
 
495 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.05 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.83 
 
 
469 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  43.81 
 
 
471 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.81 
 
 
448 aa  333  4e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  46.38 
 
 
468 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.23 
 
 
465 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.98 
 
 
460 aa  319  7e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  43.56 
 
 
496 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  45.63 
 
 
447 aa  309  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2036  Anthranilate synthase  41.4 
 
 
478 aa  307  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0992508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3709  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.59 
 
 
488 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131027  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.14 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  37.78 
 
 
448 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  44.05 
 
 
447 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.41 
 
 
480 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  45.41 
 
 
462 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.69 
 
 
461 aa  295  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  38.93 
 
 
448 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.6 
 
 
447 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.73 
 
 
450 aa  292  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  39.5 
 
 
507 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.19 
 
 
480 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  39.54 
 
 
456 aa  289  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1132  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.14 
 
 
474 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  40.78 
 
 
491 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  42.63 
 
 
443 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.27 
 
 
455 aa  286  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.52 
 
 
446 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.32 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  41.47 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.3 
 
 
446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.7 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5398  anthranilate synthase component I  42.33 
 
 
504 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  37.83 
 
 
453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  37.83 
 
 
465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.26 
 
 
741 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.72 
 
 
466 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.67 
 
 
509 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  40.09 
 
 
458 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.09 
 
 
458 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1342  anthranilate synthase, component I  37.92 
 
 
499 aa  282  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00981315  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.28 
 
 
476 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  40.09 
 
 
458 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  37.44 
 
 
458 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.96 
 
 
447 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  38.8 
 
 
494 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  39.91 
 
 
491 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.81 
 
 
454 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  41.13 
 
 
430 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.9 
 
 
467 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.58 
 
 
454 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  41.13 
 
 
430 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  40.67 
 
 
467 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.05 
 
 
470 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  47.04 
 
 
408 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.05 
 
 
470 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.58 
 
 
454 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.59 
 
 
467 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  39.34 
 
 
454 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.34 
 
 
454 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3570  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.39 
 
 
447 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  36.36 
 
 
465 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  37.34 
 
 
503 aa  276  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  41.58 
 
 
456 aa  276  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  40.22 
 
 
485 aa  276  8e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5573  anthranilate synthase component I  41.25 
 
 
504 aa  275  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  37.04 
 
 
514 aa  275  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.28 
 
 
470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.56 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1144  anthranilate synthase component I  35.65 
 
 
472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000269912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  50.94 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.52 
 
 
721 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.48 
 
 
493 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.38 
 
 
467 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.95 
 
 
456 aa  273  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  37.72 
 
 
453 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  38.72 
 
 
491 aa  272  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1291  anthranilate synthase component I  34.96 
 
 
472 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.03 
 
 
474 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  37.72 
 
 
453 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  37.72 
 
 
453 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  37.26 
 
 
465 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.21 
 
 
470 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  36.94 
 
 
517 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  37.8 
 
 
491 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.57 
 
 
474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  38.21 
 
 
465 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  37.5 
 
 
453 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>