More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3570 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3570  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  100 
 
 
447 aa  871    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.61 
 
 
474 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1898  Chorismate binding-like protein  45.77 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0230156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.18 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.18 
 
 
465 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.86 
 
 
457 aa  292  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.71 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.46 
 
 
469 aa  283  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.23 
 
 
472 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.23 
 
 
466 aa  276  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.91 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.63 
 
 
447 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.95 
 
 
447 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  41.53 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.77 
 
 
469 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.69 
 
 
455 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.14 
 
 
446 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.72 
 
 
447 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.07 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.48 
 
 
472 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  41.14 
 
 
447 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.61 
 
 
470 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  40.18 
 
 
443 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.68 
 
 
446 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.83 
 
 
470 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1132  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.68 
 
 
474 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.48 
 
 
470 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  37.13 
 
 
430 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  39.01 
 
 
453 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2603  anthranilate synthase  39.77 
 
 
432 aa  256  6e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0445726  normal  0.0808647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  39.01 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  39.01 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  36.9 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.99 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.61 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.92 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.28 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.33 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  42.92 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  39.28 
 
 
445 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  36.52 
 
 
467 aa  253  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  38.79 
 
 
453 aa  252  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.83 
 
 
467 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.19 
 
 
461 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  43.45 
 
 
454 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.12 
 
 
454 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  38.57 
 
 
453 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.57 
 
 
453 aa  250  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.57 
 
 
453 aa  250  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  38.57 
 
 
453 aa  250  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.12 
 
 
454 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.12 
 
 
454 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.36 
 
 
467 aa  249  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.12 
 
 
454 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.91 
 
 
476 aa  247  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  39.51 
 
 
468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.69 
 
 
466 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2239  anthranilate synthase  38.17 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  40.64 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.15 
 
 
721 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.44 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.78 
 
 
490 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.33 
 
 
471 aa  243  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.49 
 
 
448 aa  243  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.59 
 
 
458 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  36.59 
 
 
458 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.33 
 
 
460 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  36.59 
 
 
458 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4201  para-aminobenzoate synthase component I  43.05 
 
 
462 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0880526  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.08 
 
 
466 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  40.05 
 
 
686 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  44.07 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  36.68 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.22 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.61 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.63 
 
 
444 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.46 
 
 
477 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.84 
 
 
473 aa  230  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21661  putative p-aminobenzoate synthetase  33.87 
 
 
446 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.145928 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1294  putative p-aminobenzoate synthetase  33.87 
 
 
446 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  37.78 
 
 
509 aa  229  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  38.9 
 
 
495 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  37.67 
 
 
497 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  39.47 
 
 
458 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29681  putative p-aminobenzoate synthetase  35.16 
 
 
471 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.11 
 
 
456 aa  226  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.76 
 
 
476 aa  226  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  37.47 
 
 
456 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.65 
 
 
450 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18831  putative p-aminobenzoate synthetase  31.93 
 
 
439 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  38.59 
 
 
456 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  34.01 
 
 
453 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  36.61 
 
 
705 aa  222  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.96 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1832  hypothetical protein  37.98 
 
 
435 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.973309  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.44 
 
 
474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.36 
 
 
458 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  44.98 
 
 
476 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.41 
 
 
480 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18251  putative p-aminobenzoate synthetase  35.66 
 
 
442 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.240913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>