More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7048 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7048  Chorismate binding-like protein  100 
 
 		 412 aa  870    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2137  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  48.54 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1201  Chorismate binding  45.87 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  0.539184 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09868  para-aminobenzoate synthase, component I  45.8 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.95 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1808  p-aminobenzoate synthetase, component I  42.09 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000581236  normal  0.854034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  38.85 
 
 		 731 aa  212  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.62 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  39.63 
 
 		 714 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  44 
 
 		 686 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  37.76 
 
 		 467 aa  203  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  36.48 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  32.8 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3258  anthranilate synthase component I-like protein  33.52 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.2 
 
 		 472 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  39.85 
 
 		 495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.16 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.61 
 
 		 732 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0977  p-aminobenzoate synthetase, component I  31.7 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000344028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  30.31 
 
 		 465 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  36.4 
 
 		 468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.16 
 
 		 741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.46 
 
 		 672 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.36 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2866  anthranilate synthase component I-like protein  32.78 
 
 		 469 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.83 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1235  Chorismate binding-like protein  37.87 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.68 
 
 		 466 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1469  hypothetical protein  37.26 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.06 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.3 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.96 
 
 		 721 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  32.68 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  40.3 
 
 		 682 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.33 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  29.63 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  29.63 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  29.63 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  29.63 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  29.43 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  32.68 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  39.25 
 
 		 705 aa  192  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.8 
 
 		 469 aa  192  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  32.56 
 
 		 430 aa  192  8e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  32.56 
 
 		 430 aa  192  9e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  30.43 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.47 
 
 		 467 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  37.31 
 
 		 596 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  29.4 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1514  hypothetical protein  36.88 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.43 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.55 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  29.67 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3230  anthranilate synthase component I-like protein  32.76 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  28.53 
 
 		 465 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  28.94 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.8 
 
 		 467 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.35 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.04 
 
 		 490 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.14 
 
 		 732 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.78 
 
 		 482 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0715  hypothetical protein  38.31 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0153032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1828  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.02 
 
 		 518 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.19 
 
 		 611 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.32 
 
 		 509 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  31.67 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  31.45 
 
 		 497 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  35.79 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  35.79 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.36 
 
 		 601 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  31.56 
 
 		 408 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.98 
 
 		 466 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.47 
 
 		 762 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.06 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  35.79 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.49 
 
 		 469 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  37.99 
 
 		 612 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  35.07 
 
 		 454 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.93 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.93 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  35.79 
 
 		 454 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0411  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.13 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.3 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.34 
 
 		 476 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  39.11 
 
 		 703 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.8 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.68 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.35 
 
 		 592 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  39.13 
 
 		 509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.36 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.69 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.15 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.81 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  37.36 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  36.26 
 
 		 458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.26 
 
 		 458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1230  anthranilate synthase component I-like protein  32.6 
 
 		 484 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.438932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  32.04 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>