More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0523 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 
596 aa  1203    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  59.45 
 
 
574 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  66.16 
 
 
586 aa  767    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.8 
 
 
573 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.08 
 
 
592 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.03 
 
 
587 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.64 
 
 
584 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.83 
 
 
577 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.83 
 
 
617 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.12 
 
 
553 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.22 
 
 
601 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.46 
 
 
599 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  39.84 
 
 
615 aa  365  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.82 
 
 
587 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.62 
 
 
618 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  39.87 
 
 
612 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.33 
 
 
607 aa  342  9e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.52 
 
 
599 aa  340  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.07 
 
 
635 aa  339  9e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.9 
 
 
599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.02 
 
 
591 aa  336  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.43 
 
 
599 aa  335  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.27 
 
 
632 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.44 
 
 
611 aa  333  6e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.01 
 
 
629 aa  332  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.65 
 
 
632 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.84 
 
 
590 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  43.9 
 
 
626 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  39.84 
 
 
635 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.46 
 
 
630 aa  320  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.62 
 
 
615 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.52 
 
 
555 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  39.81 
 
 
594 aa  316  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  36.56 
 
 
595 aa  316  9e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.89 
 
 
620 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  39.53 
 
 
637 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.33 
 
 
637 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  35.99 
 
 
644 aa  312  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  36.26 
 
 
648 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.37 
 
 
621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  41.95 
 
 
623 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  38.26 
 
 
637 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  33.73 
 
 
571 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  36.1 
 
 
639 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.11 
 
 
595 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  36.83 
 
 
615 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.01 
 
 
640 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  33.39 
 
 
572 aa  290  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.67 
 
 
638 aa  290  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  36.43 
 
 
668 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  36.25 
 
 
668 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  36.25 
 
 
668 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  36.25 
 
 
668 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  36.25 
 
 
668 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  36.25 
 
 
668 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  36.4 
 
 
669 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  35.64 
 
 
669 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.7 
 
 
629 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.05 
 
 
673 aa  279  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.67 
 
 
710 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  28.78 
 
 
582 aa  264  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  34.63 
 
 
586 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.66 
 
 
594 aa  258  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.34 
 
 
594 aa  256  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.5 
 
 
594 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  41.42 
 
 
386 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  41.84 
 
 
385 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  40.81 
 
 
384 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.63 
 
 
607 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  40.44 
 
 
389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  43.73 
 
 
390 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  40.44 
 
 
389 aa  234  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  44.24 
 
 
390 aa  233  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  44.24 
 
 
381 aa  233  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  37.1 
 
 
411 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  42.53 
 
 
398 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  40.1 
 
 
385 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  42.44 
 
 
388 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  39.51 
 
 
386 aa  224  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0738  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  32.97 
 
 
383 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0754  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  32.97 
 
 
383 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.76 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.65 
 
 
469 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3709  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.56 
 
 
488 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131027  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  42.09 
 
 
509 aa  211  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.69 
 
 
452 aa  210  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.22 
 
 
456 aa  207  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.54 
 
 
467 aa  207  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.07 
 
 
466 aa  207  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.28 
 
 
470 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  42.75 
 
 
467 aa  206  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.32 
 
 
435 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1235  Chorismate binding-like protein  34.49 
 
 
393 aa  206  9e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.15 
 
 
741 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.12 
 
 
490 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.28 
 
 
470 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.12 
 
 
455 aa  204  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  43.75 
 
 
454 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.91 
 
 
470 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.28 
 
 
467 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>