More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0502 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
710 aa  1459    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.68 
 
 
611 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.81 
 
 
615 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.42 
 
 
607 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40 
 
 
618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.52 
 
 
590 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  56.52 
 
 
615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.95 
 
 
601 aa  359  8e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  35.78 
 
 
586 aa  337  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.72 
 
 
577 aa  317  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.63 
 
 
574 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  33.97 
 
 
623 aa  296  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  31.2 
 
 
571 aa  293  5e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.76 
 
 
629 aa  283  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  33.28 
 
 
635 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.06 
 
 
632 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  33.6 
 
 
644 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.08 
 
 
592 aa  273  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.26 
 
 
620 aa  273  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  32.27 
 
 
594 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.36 
 
 
635 aa  269  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  42.18 
 
 
384 aa  269  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.91 
 
 
637 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  41.67 
 
 
596 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.1 
 
 
621 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  32.62 
 
 
594 aa  267  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  32.69 
 
 
595 aa  267  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.12 
 
 
587 aa  267  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  42.26 
 
 
385 aa  267  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.68 
 
 
584 aa  267  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  32.75 
 
 
637 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  31.87 
 
 
648 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  40.99 
 
 
386 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.73 
 
 
632 aa  263  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  42.13 
 
 
398 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.65 
 
 
553 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  41.38 
 
 
389 aa  261  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  40.8 
 
 
385 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  31.57 
 
 
615 aa  259  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  41.11 
 
 
389 aa  258  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.16 
 
 
573 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  38.32 
 
 
411 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  39.69 
 
 
612 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.27 
 
 
434 aa  253  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.59 
 
 
617 aa  252  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  40.53 
 
 
386 aa  250  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  39.31 
 
 
595 aa  249  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  37.77 
 
 
572 aa  249  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.97 
 
 
741 aa  246  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  38.35 
 
 
586 aa  246  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.04 
 
 
599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  31.23 
 
 
637 aa  241  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.91 
 
 
599 aa  240  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.78 
 
 
599 aa  239  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.23 
 
 
629 aa  238  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.98 
 
 
599 aa  238  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  41.21 
 
 
388 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  45.48 
 
 
626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.05 
 
 
555 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.66 
 
 
721 aa  232  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.94 
 
 
482 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  40.31 
 
 
390 aa  229  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.15 
 
 
640 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  40.05 
 
 
381 aa  227  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  38.26 
 
 
390 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.94 
 
 
493 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  44.44 
 
 
453 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2217  Anthranilate synthase  34.98 
 
 
439 aa  225  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  43.73 
 
 
594 aa  225  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  44.49 
 
 
408 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.53 
 
 
469 aa  225  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.57 
 
 
480 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.12 
 
 
587 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  37.21 
 
 
582 aa  221  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.52 
 
 
638 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.85 
 
 
630 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1171  Chorismate binding-like protein  31.93 
 
 
732 aa  221  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416278  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.56 
 
 
509 aa  221  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  38.2 
 
 
443 aa  220  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  44.07 
 
 
468 aa  219  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.53 
 
 
466 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0738  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.36 
 
 
383 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0754  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.36 
 
 
383 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  38.86 
 
 
447 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  40.22 
 
 
430 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  40.22 
 
 
430 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.11 
 
 
466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.41 
 
 
466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.94 
 
 
480 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.16 
 
 
460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  37.08 
 
 
668 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  37.08 
 
 
668 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  37.08 
 
 
668 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  37.08 
 
 
668 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  37.08 
 
 
668 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.77 
 
 
435 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  41.63 
 
 
465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  37.08 
 
 
668 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.35 
 
 
447 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  41.98 
 
 
447 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>