More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0332 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
573 aa  1155    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  62.92 
 
 
574 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  56.44 
 
 
586 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  54.8 
 
 
596 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.11 
 
 
587 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.92 
 
 
592 aa  488  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.32 
 
 
584 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.86 
 
 
577 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.86 
 
 
601 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.98 
 
 
618 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.33 
 
 
590 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.37 
 
 
617 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.01 
 
 
611 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.73 
 
 
607 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.49 
 
 
553 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.93 
 
 
621 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  41.54 
 
 
612 aa  363  3e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  41.71 
 
 
615 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.14 
 
 
615 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  39.54 
 
 
635 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.93 
 
 
620 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.11 
 
 
632 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.27 
 
 
599 aa  352  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  39.24 
 
 
637 aa  353  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  39.87 
 
 
644 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.24 
 
 
637 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  39.63 
 
 
648 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.87 
 
 
632 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.1 
 
 
615 aa  347  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.55 
 
 
640 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.6 
 
 
630 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  39.63 
 
 
639 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  41.15 
 
 
626 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.83 
 
 
638 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  35.95 
 
 
571 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  40.64 
 
 
669 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.72 
 
 
587 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.69 
 
 
599 aa  336  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.56 
 
 
555 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.22 
 
 
629 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  38.83 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  40.97 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.03 
 
 
595 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  40.97 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  40.97 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  40.97 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  40.97 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  39.54 
 
 
595 aa  320  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  40.78 
 
 
668 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  40.71 
 
 
669 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  34.04 
 
 
572 aa  316  6e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.39 
 
 
599 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.79 
 
 
635 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.39 
 
 
599 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.44 
 
 
629 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  40.86 
 
 
623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.57 
 
 
591 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  38.3 
 
 
637 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.05 
 
 
673 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  36.41 
 
 
586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  36.67 
 
 
607 aa  272  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.16 
 
 
710 aa  269  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  43.13 
 
 
389 aa  263  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  31.91 
 
 
594 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  31.91 
 
 
594 aa  258  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  32.1 
 
 
594 aa  257  4e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  42.32 
 
 
389 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  42.62 
 
 
386 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  30.1 
 
 
582 aa  249  7e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  43.77 
 
 
398 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  40.65 
 
 
386 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  40.88 
 
 
385 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  40.88 
 
 
385 aa  243  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  44.41 
 
 
390 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  39.84 
 
 
384 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  44.41 
 
 
390 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  44.14 
 
 
381 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  37.37 
 
 
411 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  41.9 
 
 
388 aa  233  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  45.96 
 
 
453 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  45.96 
 
 
408 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.39 
 
 
741 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0738  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  33.88 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.78 
 
 
721 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0754  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  33.88 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.37 
 
 
466 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.66 
 
 
466 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  43.4 
 
 
502 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  39.61 
 
 
509 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  40.14 
 
 
495 aa  210  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.42 
 
 
466 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.98 
 
 
450 aa  210  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  43.21 
 
 
462 aa  210  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.21 
 
 
480 aa  210  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.49 
 
 
480 aa  210  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  37.54 
 
 
485 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.66 
 
 
470 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.66 
 
 
470 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.47 
 
 
444 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  42.35 
 
 
489 aa  207  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>