More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0648 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  65.67 
 
 		 621 aa  797    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  85.27 
 
 		 620 aa  1077    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  69.21 
 
 		 668 aa  848    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  69.21 
 
 		 668 aa  848    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  91.56 
 
 		 648 aa  1145    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  69.21 
 
 		 668 aa  848    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  69.21 
 
 		 668 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  89.44 
 
 		 644 aa  1124    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  69.72 
 
 		 669 aa  867    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  68.81 
 
 		 669 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  69.06 
 
 		 668 aa  845    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  64.62 
 
 		 640 aa  792    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  69.21 
 
 		 668 aa  848    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  89.51 
 
 		 637 aa  1108    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  90.14 
 
 		 635 aa  1114    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.99 
 
 		 638 aa  793    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  100 
 
 		 639 aa  1280    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  89.67 
 
 		 637 aa  1110    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  54.85 
 
 		 623 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.31 
 
 		 630 aa  608  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.09 
 
 		 632 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.16 
 
 		 632 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.32 
 
 		 673 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  51.91 
 
 		 626 aa  534  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.52 
 
 		 629 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  49.15 
 
 		 637 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  48.08 
 
 		 595 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  40.59 
 
 		 607 aa  429  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.16 
 
 		 629 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.12 
 
 		 555 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.13 
 
 		 573 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.33 
 
 		 601 aa  340  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.15 
 
 		 618 aa  330  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  40.34 
 
 		 612 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.62 
 
 		 587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.06 
 
 		 574 aa  328  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.46 
 
 		 607 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.07 
 
 		 586 aa  319  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.82 
 
 		 584 aa  316  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  38.54 
 
 		 595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  36.1 
 
 		 596 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.59 
 
 		 590 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.19 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.46 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.53 
 
 		 599 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  35.67 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.82 
 
 		 599 aa  296  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.04 
 
 		 617 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  39.92 
 
 		 594 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.86 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.95 
 
 		 592 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.33 
 
 		 611 aa  287  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.04 
 
 		 599 aa  283  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  34.64 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.32 
 
 		 710 aa  273  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.15 
 
 		 591 aa  273  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  35.15 
 
 		 615 aa  270  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.38 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  38.45 
 
 		 615 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.08 
 
 		 594 aa  259  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.48 
 
 		 635 aa  257  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.62 
 
 		 594 aa  253  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.46 
 
 		 594 aa  251  4e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.7 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  34.37 
 
 		 586 aa  233  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  28.04 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  47.75 
 
 		 385 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  40.94 
 
 		 386 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  42.66 
 
 		 389 aa  211  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  42.32 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  44.09 
 
 		 388 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0754  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  33.42 
 
 		 383 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0738  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  33.42 
 
 		 383 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  43.33 
 
 		 390 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  42.5 
 
 		 398 aa  204  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  43.1 
 
 		 411 aa  201  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  43.21 
 
 		 386 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  43.21 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  42.51 
 
 		 384 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  42.58 
 
 		 381 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  42.35 
 
 		 390 aa  197  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.76 
 
 		 480 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.58 
 
 		 480 aa  191  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  42.58 
 
 		 462 aa  190  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.69 
 
 		 741 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  34.09 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  33.75 
 
 		 408 aa  187  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4527  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  41.33 
 
 		 437 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.06 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.44 
 
 		 466 aa  184  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.68 
 
 		 466 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  35.19 
 
 		 471 aa  181  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.39 
 
 		 452 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.96 
 
 		 472 aa  180  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  34.11 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.08 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.93 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.2 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  34.11 
 
 		 430 aa  179  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  39.4 
 
 		 447 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>