More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0362 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  100 
 
 
390 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  86.72 
 
 
390 aa  634    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  86.54 
 
 
381 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  62.05 
 
 
388 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  53.87 
 
 
398 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  49.33 
 
 
385 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  47.73 
 
 
389 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  51.56 
 
 
385 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  47.2 
 
 
389 aa  319  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  47.64 
 
 
386 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  47.58 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  45.41 
 
 
411 aa  310  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  47.33 
 
 
386 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.22 
 
 
601 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.53 
 
 
587 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.69 
 
 
607 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.75 
 
 
629 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  46.52 
 
 
595 aa  259  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  47.09 
 
 
555 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.67 
 
 
611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.28 
 
 
618 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  52.61 
 
 
468 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.56 
 
 
599 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  45.23 
 
 
447 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.41 
 
 
630 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.04 
 
 
584 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.96 
 
 
615 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  43.43 
 
 
596 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  43.27 
 
 
586 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  50.75 
 
 
408 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.4 
 
 
553 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.99 
 
 
467 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.41 
 
 
573 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  44.59 
 
 
594 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  44.96 
 
 
467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.6 
 
 
467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.41 
 
 
574 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.99 
 
 
467 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.96 
 
 
710 aa  233  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  36.97 
 
 
571 aa  232  9e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  46.63 
 
 
612 aa  232  9e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  47.74 
 
 
471 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  48.68 
 
 
471 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  46.2 
 
 
447 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.62 
 
 
470 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.57 
 
 
590 aa  231  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.35 
 
 
470 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.67 
 
 
474 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.01 
 
 
599 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.32 
 
 
466 aa  229  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  50 
 
 
453 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.06 
 
 
480 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.22 
 
 
592 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  49.06 
 
 
462 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.79 
 
 
470 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.97 
 
 
470 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.55 
 
 
474 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.84 
 
 
632 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  43.01 
 
 
587 aa  227  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.08 
 
 
480 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.44 
 
 
447 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.21 
 
 
458 aa  226  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.09 
 
 
632 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.82 
 
 
640 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  51.08 
 
 
637 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.81 
 
 
490 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.4 
 
 
460 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  46.04 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.58 
 
 
449 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.01 
 
 
473 aa  222  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  36.54 
 
 
572 aa  222  7e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.94 
 
 
446 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.04 
 
 
721 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.84 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.99 
 
 
447 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.67 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.94 
 
 
446 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  51.62 
 
 
626 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.03 
 
 
615 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  50 
 
 
466 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  51.85 
 
 
595 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.38 
 
 
469 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.87 
 
 
617 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.42 
 
 
474 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  48.07 
 
 
623 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  41.73 
 
 
497 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.01 
 
 
447 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.8 
 
 
461 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  39.04 
 
 
586 aa  217  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.68 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  42.86 
 
 
456 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.68 
 
 
456 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  43.19 
 
 
458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  44.85 
 
 
509 aa  216  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.69 
 
 
620 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  43.45 
 
 
453 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.86 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  43.45 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  43.77 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>