More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0633 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  100 
 
 		 398 aa  807    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  55.44 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  53.68 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  55.17 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  53.68 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  53.87 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  54.13 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  51.34 
 
 		 386 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  51.34 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  50.8 
 
 		 384 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  50.27 
 
 		 385 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  52.85 
 
 		 385 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  47.52 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.85 
 
 		 601 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.08 
 
 		 607 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.39 
 
 		 710 aa  279  8e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.82 
 
 		 615 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.37 
 
 		 611 aa  269  8e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  44.22 
 
 		 595 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.19 
 
 		 618 aa  262  6.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.49 
 
 		 587 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.77 
 
 		 573 aa  255  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  39.73 
 
 		 571 aa  255  9e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.74 
 
 		 629 aa  255  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.81 
 
 		 592 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.35 
 
 		 590 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  36.14 
 
 		 572 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.26 
 
 		 555 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.1 
 
 		 574 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.71 
 
 		 630 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  42.53 
 
 		 596 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.79 
 
 		 586 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.47 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  43.44 
 
 		 612 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.47 
 
 		 599 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.18 
 
 		 599 aa  239  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.93 
 
 		 617 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.77 
 
 		 553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  48.89 
 
 		 480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.14 
 
 		 632 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.11 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.61 
 
 		 577 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.18 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  42.98 
 
 		 637 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.72 
 
 		 509 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.58 
 
 		 587 aa  230  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.58 
 
 		 474 aa  230  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  48.82 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  43.58 
 
 		 626 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.1 
 
 		 632 aa  229  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.38 
 
 		 638 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.59 
 
 		 640 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.83 
 
 		 599 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  46.85 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.97 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.04 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.54 
 
 		 584 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.86 
 
 		 620 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  34.37 
 
 		 594 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.3 
 
 		 470 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.68 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  40.81 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  47.06 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  44.48 
 
 		 635 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.91 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.34 
 
 		 466 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  40.62 
 
 		 623 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.41 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.03 
 
 		 621 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  49.45 
 
 		 595 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.22 
 
 		 615 aa  219  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.68 
 
 		 470 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  43.26 
 
 		 637 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.26 
 
 		 637 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  44.91 
 
 		 456 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  34.08 
 
 		 594 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  36.63 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  40.07 
 
 		 497 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  34.38 
 
 		 594 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  38.4 
 
 		 615 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  45.8 
 
 		 447 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  43.52 
 
 		 648 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  40.16 
 
 		 594 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.69 
 
 		 466 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  47.45 
 
 		 458 aa  216  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.88 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.49 
 
 		 629 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.28 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.25 
 
 		 474 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  45.86 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.86 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.1 
 
 		 467 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.88 
 
 		 461 aa  212  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.04 
 
 		 470 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  40.76 
 
 		 668 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  40.76 
 
 		 668 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  40.76 
 
 		 668 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  40.76 
 
 		 668 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.06 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.03 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>