More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2474 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  100 
 
 
381 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  98.95 
 
 
390 aa  740    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  86.54 
 
 
390 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  64.66 
 
 
388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  54.38 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  51.4 
 
 
385 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  48.38 
 
 
385 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  50.69 
 
 
386 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  49.58 
 
 
384 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  47.5 
 
 
389 aa  315  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  46.94 
 
 
389 aa  309  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  47.96 
 
 
386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  46.13 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.35 
 
 
601 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.32 
 
 
607 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45 
 
 
587 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.47 
 
 
611 aa  259  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  45.48 
 
 
595 aa  259  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.96 
 
 
629 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  47.78 
 
 
555 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  44.24 
 
 
596 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.74 
 
 
584 aa  245  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.85 
 
 
599 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  53.14 
 
 
468 aa  242  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.04 
 
 
599 aa  242  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.76 
 
 
615 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.76 
 
 
630 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.6 
 
 
618 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.27 
 
 
553 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.21 
 
 
590 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.1 
 
 
574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.14 
 
 
573 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.05 
 
 
710 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.48 
 
 
592 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  42.78 
 
 
623 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.66 
 
 
586 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.33 
 
 
470 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  47.25 
 
 
640 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  46.07 
 
 
467 aa  229  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.06 
 
 
470 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.3 
 
 
474 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  46.09 
 
 
612 aa  229  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  36.69 
 
 
571 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  46.79 
 
 
471 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  51.09 
 
 
637 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  50.55 
 
 
480 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.32 
 
 
617 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  37.08 
 
 
572 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  50.37 
 
 
594 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.09 
 
 
467 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  45.06 
 
 
408 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  45.43 
 
 
587 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  49.06 
 
 
462 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.06 
 
 
480 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.17 
 
 
466 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  47.37 
 
 
447 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.26 
 
 
467 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.31 
 
 
470 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.24 
 
 
467 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.13 
 
 
470 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.11 
 
 
632 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.84 
 
 
460 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.82 
 
 
490 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  47.73 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.12 
 
 
599 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.36 
 
 
632 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.12 
 
 
599 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  52.52 
 
 
626 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  48.35 
 
 
447 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.03 
 
 
452 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.36 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.04 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  46.42 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  44.14 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.49 
 
 
595 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45 
 
 
467 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.08 
 
 
458 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.5 
 
 
638 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.26 
 
 
455 aa  216  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  43.02 
 
 
615 aa  215  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.31 
 
 
473 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.42 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.1 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.1 
 
 
446 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  36.75 
 
 
497 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  38.58 
 
 
586 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.62 
 
 
469 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  43.82 
 
 
453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.48 
 
 
464 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.07 
 
 
447 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.3 
 
 
447 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.53 
 
 
476 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  43.82 
 
 
453 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  43.82 
 
 
445 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  43.82 
 
 
453 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.95 
 
 
577 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  44.15 
 
 
453 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.57 
 
 
466 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.66 
 
 
721 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.64 
 
 
620 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>