More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2633 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  100 
 
 
626 aa  1242    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  82.83 
 
 
632 aa  1019    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  82.9 
 
 
632 aa  1003    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.42 
 
 
638 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.43 
 
 
621 aa  582  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.21 
 
 
620 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.39 
 
 
630 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  54.67 
 
 
623 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  52.78 
 
 
640 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  52.29 
 
 
648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  52.55 
 
 
637 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  52.23 
 
 
637 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.23 
 
 
637 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  52.23 
 
 
635 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  51.98 
 
 
644 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  49.78 
 
 
669 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  51.91 
 
 
639 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  53.82 
 
 
595 aa  535  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  48.61 
 
 
669 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  48.68 
 
 
668 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  48.68 
 
 
668 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  48.68 
 
 
668 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  48.68 
 
 
668 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  48.68 
 
 
668 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  48.68 
 
 
668 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.66 
 
 
629 aa  502  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50 
 
 
673 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  41.18 
 
 
607 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.51 
 
 
629 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.59 
 
 
584 aa  349  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.77 
 
 
601 aa  346  6e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  42.05 
 
 
612 aa  343  7e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  45.29 
 
 
555 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.29 
 
 
574 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  43.9 
 
 
596 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.89 
 
 
607 aa  333  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.81 
 
 
573 aa  333  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.86 
 
 
618 aa  329  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.23 
 
 
587 aa  329  8e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.25 
 
 
586 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.01 
 
 
592 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.19 
 
 
617 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.82 
 
 
599 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.65 
 
 
615 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.96 
 
 
577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.88 
 
 
615 aa  306  9.000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.78 
 
 
611 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  42.51 
 
 
594 aa  303  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.58 
 
 
590 aa  302  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  39.65 
 
 
595 aa  296  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  35.77 
 
 
572 aa  296  7e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44 
 
 
599 aa  294  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  35.17 
 
 
571 aa  292  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.83 
 
 
553 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.73 
 
 
599 aa  276  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.14 
 
 
591 aa  273  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  39.88 
 
 
615 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.05 
 
 
594 aa  270  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.59 
 
 
635 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.55 
 
 
594 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.55 
 
 
594 aa  265  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.54 
 
 
599 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  30.12 
 
 
582 aa  260  6e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  38.04 
 
 
586 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.48 
 
 
710 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.92 
 
 
587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  50.52 
 
 
388 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  51.62 
 
 
390 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  47.77 
 
 
398 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  52.52 
 
 
390 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  52.52 
 
 
381 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.64 
 
 
741 aa  219  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  48.57 
 
 
385 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  46.15 
 
 
453 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  46.15 
 
 
408 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.27 
 
 
466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.42 
 
 
447 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.84 
 
 
466 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.57 
 
 
509 aa  209  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.08 
 
 
490 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.38 
 
 
480 aa  208  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  43.48 
 
 
411 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  45.82 
 
 
447 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  43.59 
 
 
471 aa  205  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  46.55 
 
 
384 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.58 
 
 
455 aa  203  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  46.91 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  44.73 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.73 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.5 
 
 
469 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  44.03 
 
 
468 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.69 
 
 
480 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  45.25 
 
 
686 aa  201  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  46.02 
 
 
385 aa  200  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.23 
 
 
482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.28 
 
 
471 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  43.3 
 
 
454 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0411  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.93 
 
 
434 aa  196  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  43.3 
 
 
454 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  43.3 
 
 
454 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>