More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0939 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  67.17 
 
 		 599 aa  721    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 		 591 aa  1187    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  68.34 
 
 		 599 aa  744    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  68.73 
 
 		 599 aa  773    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  72.64 
 
 		 594 aa  792    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  68.61 
 
 		 599 aa  735    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  48.48 
 
 		 615 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.49 
 
 		 601 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.93 
 
 		 584 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.16 
 
 		 577 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.5 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.38 
 
 		 617 aa  361  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  42.53 
 
 		 596 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.14 
 
 		 587 aa  360  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.8 
 
 		 635 aa  340  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  35.07 
 
 		 572 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.33 
 
 		 574 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.12 
 
 		 592 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  41 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  34.07 
 
 		 571 aa  327  5e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.1 
 
 		 587 aa  319  9e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.24 
 
 		 555 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.92 
 
 		 573 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  39.36 
 
 		 612 aa  308  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.24 
 
 		 611 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  36.88 
 
 		 590 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.57 
 
 		 630 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.86 
 
 		 620 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.13 
 
 		 621 aa  300  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  38.4 
 
 		 595 aa  296  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.66 
 
 		 595 aa  296  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.59 
 
 		 618 aa  293  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.14 
 
 		 638 aa  293  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.55 
 
 		 632 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.5 
 
 		 632 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.17 
 
 		 640 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  41.79 
 
 		 635 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  42 
 
 		 637 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.92 
 
 		 637 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.15 
 
 		 607 aa  286  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  41.65 
 
 		 623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.07 
 
 		 629 aa  283  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  39.96 
 
 		 648 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  39.73 
 
 		 637 aa  280  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.68 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.78 
 
 		 615 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  40.45 
 
 		 644 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  40.34 
 
 		 639 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  42.54 
 
 		 626 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.61 
 
 		 673 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.2 
 
 		 607 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  37.18 
 
 		 668 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  37.18 
 
 		 668 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  37.18 
 
 		 668 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  37.18 
 
 		 668 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  37.18 
 
 		 668 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  35.65 
 
 		 615 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  36.66 
 
 		 668 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  41.55 
 
 		 389 aa  246  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  43.32 
 
 		 385 aa  244  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0754  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  38.19 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0738  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  38.19 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  41.29 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  40.7 
 
 		 386 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  34.33 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  42.43 
 
 		 385 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  40.74 
 
 		 386 aa  233  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  26.04 
 
 		 594 aa  231  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  25.92 
 
 		 594 aa  231  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  43.08 
 
 		 390 aa  230  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  39.62 
 
 		 384 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  45.4 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  25.92 
 
 		 594 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  43.5 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.06 
 
 		 710 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  41.94 
 
 		 388 aa  223  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  25.71 
 
 		 582 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  40.78 
 
 		 398 aa  216  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  37.03 
 
 		 411 aa  211  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.22 
 
 		 509 aa  196  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  34.44 
 
 		 471 aa  192  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.32 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.01 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.24 
 
 		 466 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  40.43 
 
 		 408 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.5 
 
 		 469 aa  187  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  48.36 
 
 		 669 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  40.67 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  35.16 
 
 		 467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.03 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.69 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.01 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.26 
 
 		 467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  41.03 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  47.54 
 
 		 669 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37 
 
 		 470 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.27 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.34 
 
 		 732 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.46 
 
 		 454 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.46 
 
 		 454 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>