More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3703 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  100 
 
 		 411 aa  845    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  60.58 
 
 		 386 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  60.55 
 
 		 384 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  59.55 
 
 		 385 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  53.5 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  53 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  53.02 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  51.97 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  47.52 
 
 		 398 aa  315  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  45.41 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  46.13 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  46.13 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  42.93 
 
 		 388 aa  282  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.53 
 
 		 607 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.86 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.34 
 
 		 611 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.13 
 
 		 615 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.04 
 
 		 587 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  40.29 
 
 		 595 aa  255  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.32 
 
 		 710 aa  255  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.15 
 
 		 618 aa  253  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.08 
 
 		 629 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.53 
 
 		 590 aa  243  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  40.25 
 
 		 587 aa  242  9e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  40.63 
 
 		 612 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  36.68 
 
 		 572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.07 
 
 		 592 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.58 
 
 		 577 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.78 
 
 		 584 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.85 
 
 		 615 aa  230  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  37.1 
 
 		 596 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.01 
 
 		 586 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  34.03 
 
 		 571 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.37 
 
 		 573 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.56 
 
 		 599 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.89 
 
 		 574 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.01 
 
 		 732 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  36.32 
 
 		 615 aa  212  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.06 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  37.91 
 
 		 408 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.25 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.81 
 
 		 555 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  38.46 
 
 		 453 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.3 
 
 		 632 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  42.46 
 
 		 430 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.45 
 
 		 632 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  42.46 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.49 
 
 		 621 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  43.01 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  43.54 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.71 
 
 		 630 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.05 
 
 		 620 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.08 
 
 		 617 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  42.66 
 
 		 637 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.42 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  42.8 
 
 		 453 aa  203  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.7 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.57 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  39.38 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  44.41 
 
 		 626 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.38 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.33 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2217  Anthranilate synthase  33.66 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.5 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.52 
 
 		 599 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  42.91 
 
 		 635 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.78 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.52 
 
 		 599 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  41.73 
 
 		 607 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.73 
 
 		 672 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  40.73 
 
 		 668 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  39.93 
 
 		 497 aa  199  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  43.01 
 
 		 443 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  40.73 
 
 		 668 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  40.73 
 
 		 668 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  40.73 
 
 		 668 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.78 
 
 		 640 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.16 
 
 		 467 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  40.73 
 
 		 668 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  40.73 
 
 		 668 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  40.28 
 
 		 731 aa  198  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  40.61 
 
 		 669 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  42.22 
 
 		 468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  39.93 
 
 		 714 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  43.05 
 
 		 637 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.05 
 
 		 637 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.69 
 
 		 638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.01 
 
 		 635 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  40.6 
 
 		 623 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  40.3 
 
 		 669 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.11 
 
 		 718 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.87 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  41.64 
 
 		 456 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.81 
 
 		 490 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.7 
 
 		 469 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  40.83 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  42.07 
 
 		 594 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.67 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.45 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  39.21 
 
 		 594 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>