More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4435 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  100 
 
 		 388 aa  775    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  64.63 
 
 		 390 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  64.66 
 
 		 381 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  62.05 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  53.91 
 
 		 385 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  55.59 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  49.6 
 
 		 389 aa  332  8e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  49.06 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  48.48 
 
 		 385 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  49.73 
 
 		 386 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  45.84 
 
 		 386 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  45.75 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  44.19 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.32 
 
 		 607 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.43 
 
 		 611 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  45.84 
 
 		 595 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.44 
 
 		 601 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.56 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.9 
 
 		 587 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.02 
 
 		 629 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  43.27 
 
 		 586 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.99 
 
 		 555 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.36 
 
 		 710 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.29 
 
 		 615 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.66 
 
 		 584 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.74 
 
 		 590 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  51.62 
 
 		 637 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  50.54 
 
 		 408 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.63 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.9 
 
 		 592 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.5 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.25 
 
 		 632 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  43.24 
 
 		 596 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50 
 
 		 632 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  49.25 
 
 		 468 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  50.18 
 
 		 453 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  36.97 
 
 		 572 aa  236  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  37.36 
 
 		 571 aa  236  7e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.62 
 
 		 630 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.63 
 
 		 620 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  50.68 
 
 		 626 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  47.57 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.21 
 
 		 574 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.91 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  48.78 
 
 		 623 aa  229  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  42.94 
 
 		 447 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.55 
 
 		 446 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.55 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.57 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.38 
 
 		 553 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.27 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  43.27 
 
 		 447 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.69 
 
 		 466 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.9 
 
 		 573 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.15 
 
 		 617 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  45.78 
 
 		 640 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.33 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.1 
 
 		 721 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.01 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.32 
 
 		 599 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  41.5 
 
 		 686 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.72 
 
 		 474 aa  222  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  43.43 
 
 		 594 aa  222  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.69 
 
 		 455 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.05 
 
 		 599 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.61 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.42 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.32 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  46.42 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.7 
 
 		 474 aa  219  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.39 
 
 		 577 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.35 
 
 		 629 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  38.19 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  37.77 
 
 		 456 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  50 
 
 		 595 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.35 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.88 
 
 		 480 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  36.01 
 
 		 607 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.43 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  38.14 
 
 		 458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.77 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.48 
 
 		 638 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  44 
 
 		 612 aa  216  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  44.59 
 
 		 648 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  38.99 
 
 		 586 aa  216  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  45.63 
 
 		 635 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.32 
 
 		 490 aa  216  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.03 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.03 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  37.24 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.83 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  37.24 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.39 
 
 		 587 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.67 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.01 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  43.11 
 
 		 668 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  43.11 
 
 		 668 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  43.11 
 
 		 668 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  42.99 
 
 		 669 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.69 
 
 		 637 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>