More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4527 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4527  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  100 
 
 
437 aa  879    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  36.54 
 
 
714 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.09 
 
 
718 aa  245  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.88 
 
 
732 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  34.39 
 
 
731 aa  241  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.39 
 
 
700 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  38.15 
 
 
703 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  39.02 
 
 
686 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.6 
 
 
732 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2111  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.61 
 
 
687 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0378177  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1044  para-aminobenzoate synthase, component I  36.6 
 
 
704 aa  226  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.869303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.91 
 
 
672 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  43.6 
 
 
495 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.76 
 
 
762 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  44.15 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  34.68 
 
 
705 aa  219  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  44.15 
 
 
430 aa  220  5e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  43.66 
 
 
448 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  43.66 
 
 
448 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  47.39 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  43.12 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1828  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.62 
 
 
518 aa  217  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.27 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3391  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38 
 
 
637 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.66 
 
 
458 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.72 
 
 
466 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.1 
 
 
719 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.16 
 
 
474 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  42.75 
 
 
456 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.69 
 
 
474 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  34.93 
 
 
682 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.96 
 
 
457 aa  209  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.94 
 
 
721 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  44.44 
 
 
458 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.62 
 
 
472 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.28 
 
 
467 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.61 
 
 
466 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.86 
 
 
470 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.69 
 
 
476 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.26 
 
 
466 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.28 
 
 
467 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.28 
 
 
467 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.42 
 
 
469 aa  206  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.2 
 
 
470 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.39 
 
 
464 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2036  Anthranilate synthase  44.98 
 
 
478 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0992508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  42.54 
 
 
467 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.54 
 
 
457 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06300  aminodeoxychorismate synthase, component I  50.74 
 
 
527 aa  205  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0721872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.49 
 
 
470 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  41.52 
 
 
458 aa  203  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.99 
 
 
435 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.04 
 
 
444 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  41.52 
 
 
458 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.42 
 
 
467 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.12 
 
 
469 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.65 
 
 
472 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.12 
 
 
470 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.52 
 
 
458 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.97 
 
 
480 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.2 
 
 
607 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.12 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.34 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  45.15 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42151  predicted protein  36.02 
 
 
760 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.062393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  42.59 
 
 
385 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2137  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  35.23 
 
 
428 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.67 
 
 
474 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  38.44 
 
 
385 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  44.03 
 
 
408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.6 
 
 
471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.11 
 
 
611 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.4 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.58 
 
 
490 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.52 
 
 
638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.99 
 
 
447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  41.79 
 
 
471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  42.91 
 
 
571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  44.78 
 
 
447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  42.01 
 
 
456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.07 
 
 
460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  40.94 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.42 
 
 
473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0411  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.4 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.12 
 
 
480 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.97 
 
 
446 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  38.87 
 
 
465 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0342  anthranilate synthase component I  34.4 
 
 
469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0367738  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1898  Chorismate binding-like protein  45.49 
 
 
464 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0230156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.34 
 
 
447 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.26 
 
 
710 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.61 
 
 
446 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.12 
 
 
477 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.85 
 
 
629 aa  196  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.91 
 
 
452 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.96 
 
 
465 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  37.97 
 
 
386 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0875  hypothetical protein  43.51 
 
 
454 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  40.46 
 
 
465 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  40.46 
 
 
465 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>