More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2111 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  65.34 
 
 
700 aa  843    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.76 
 
 
718 aa  694    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  53.98 
 
 
703 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2111  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
687 aa  1352    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0378177  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  44.72 
 
 
731 aa  598  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  46.42 
 
 
714 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.18 
 
 
762 aa  592  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.13 
 
 
732 aa  591  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.47 
 
 
732 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1044  para-aminobenzoate synthase, component I  44.35 
 
 
704 aa  551  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.869303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  44.27 
 
 
705 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  48.44 
 
 
686 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3391  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.63 
 
 
637 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.86 
 
 
672 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42151  predicted protein  42.08 
 
 
760 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.062393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.05 
 
 
721 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05730  4-amino-4-deoxychorismate synthase, putative  33.25 
 
 
809 aa  313  6.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1828  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.74 
 
 
518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  43.26 
 
 
682 aa  287  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74393  para-aminobenzoate synthase, (PABA)  28.74 
 
 
769 aa  261  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.38 
 
 
719 aa  259  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.77 
 
 
466 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.22 
 
 
474 aa  258  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.76 
 
 
461 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06300  aminodeoxychorismate synthase, component I  44.35 
 
 
527 aa  255  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0721872  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.48 
 
 
460 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  36.12 
 
 
430 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  40.22 
 
 
462 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.22 
 
 
480 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.36 
 
 
458 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.96 
 
 
444 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  36.36 
 
 
458 aa  250  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  36.67 
 
 
430 aa  250  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  36.36 
 
 
458 aa  250  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  38.84 
 
 
496 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.88 
 
 
467 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.37 
 
 
467 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  48.24 
 
 
467 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.83 
 
 
471 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  37.98 
 
 
491 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  38.1 
 
 
468 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  37.42 
 
 
489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.5 
 
 
467 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.14 
 
 
448 aa  243  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  36.44 
 
 
491 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  35.62 
 
 
495 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.92 
 
 
447 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.38 
 
 
470 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.24 
 
 
470 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.96 
 
 
452 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  39.66 
 
 
453 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  52.47 
 
 
480 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4527  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  41.06 
 
 
437 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.98 
 
 
458 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0157  anthranilate synthase component I  33.4 
 
 
501 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.91 
 
 
470 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.38 
 
 
455 aa  237  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.44 
 
 
456 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  38.8 
 
 
456 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  38.24 
 
 
485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.36 
 
 
450 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  37.31 
 
 
491 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  38.2 
 
 
491 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.32 
 
 
454 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0179  anthranilate synthase component I  33.2 
 
 
501 aa  233  6e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35 
 
 
466 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  36.36 
 
 
487 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.8 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.45 
 
 
470 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  38.2 
 
 
447 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3997  anthranilate synthase component I  35.44 
 
 
496 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346347  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  36.54 
 
 
491 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  37.63 
 
 
497 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.04 
 
 
454 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.26 
 
 
464 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  47.45 
 
 
471 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.37 
 
 
447 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.58 
 
 
446 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  36.5 
 
 
491 aa  231  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.94 
 
 
472 aa  231  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  34.95 
 
 
496 aa  231  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  37.77 
 
 
454 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  35.79 
 
 
494 aa  230  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  36.89 
 
 
458 aa  230  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.93 
 
 
741 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  35.2 
 
 
453 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.78 
 
 
466 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  36.84 
 
 
453 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.07 
 
 
480 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.07 
 
 
457 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  34.29 
 
 
485 aa  228  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  37.77 
 
 
454 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  38.29 
 
 
443 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.4 
 
 
465 aa  228  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  36.84 
 
 
453 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  36.84 
 
 
453 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  36.7 
 
 
445 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  36.67 
 
 
491 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.97 
 
 
453 aa  227  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  35.93 
 
 
507 aa  227  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>