More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0576 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0576  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00329112  normal  0.259763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0356  aminotransferase class IV  64.12 
 
 		 283 aa  360  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121137  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4367  aminotransferase class IV  53.44 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0511532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4306  aminotransferase class IV  53.44 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3756  aminotransferase class IV  52.9 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.64171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.45 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  25.44 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  25.29 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  24.71 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  24.57 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  27.96 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  29.02 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  27.96 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  22.31 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  26.43 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  25.82 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  31.5 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  31.5 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.07 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  27.34 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  26.69 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  25.57 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  24.57 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  25.87 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  25.29 
 
 		 291 aa  72  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  24.83 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  29.46 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  24.65 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  26.29 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.74 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  27.27 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  27.51 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  26.98 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  26.53 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  26.53 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  23.4 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  24.83 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  23.46 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  22.99 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  24.62 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  23.31 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  25.38 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  25.76 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  25.85 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  24.3 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  28.08 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  24.89 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  21.69 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  22.18 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  25 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  23.57 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.03 
 
 		 632 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  24.52 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  25.91 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.53 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  22.26 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.62 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  21.8 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  21.8 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  23.66 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  21.8 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  21.8 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  21.8 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  21.8 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  21.8 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  21.8 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  25.27 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.9 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  23.74 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.26 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  24.52 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  23.25 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  23.99 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  24.19 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  24.55 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  23.91 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  24.03 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  23.57 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  23.97 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>