More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3756 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3756  aminotransferase class IV  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.64171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4306  aminotransferase class IV  60.23 
 
 
269 aa  331  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4367  aminotransferase class IV  60.23 
 
 
269 aa  329  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0511532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0356  aminotransferase class IV  54.83 
 
 
283 aa  299  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0576  aminotransferase, class IV  52.9 
 
 
263 aa  297  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00329112  normal  0.259763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.2 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  27.14 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  26.18 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  28.68 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  23.9 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  23.9 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  27.59 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
309 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
309 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
309 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
309 aa  72  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  27.2 
 
 
285 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  26.92 
 
 
309 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
309 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
309 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
309 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
309 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  27.69 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  25.84 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  25.55 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  26.12 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.27 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  25.9 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  25.69 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  28.75 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1085  aminotransferase class IV  26.05 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  26.15 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  26.15 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  26.15 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  24.12 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  24.24 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  23.99 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  28.64 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  25.97 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  26.57 
 
 
307 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  25.32 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  25.6 
 
 
287 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  25.77 
 
 
308 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  25.6 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  23.48 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  22.64 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  25.77 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  25.6 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  26.94 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.14 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  25.1 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  25.32 
 
 
309 aa  62  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  23.19 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  23.44 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  24.81 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  23.76 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  24.58 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.19 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  23.66 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  25.1 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.79 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  23.11 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  36.11 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0976  branched-chain amino acid aminotransferase family protein  25.2 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167546  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.79 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  25.94 
 
 
741 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.79 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.79 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.67 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.48 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  28.44 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  23.65 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  24.71 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  25.37 
 
 
307 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.73 
 
 
271 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.54 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.11 
 
 
632 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  24.54 
 
 
307 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.57 
 
 
290 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.57 
 
 
265 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  25.68 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.27 
 
 
268 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  26.72 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.96 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.67 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  24.71 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  26.77 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  25.68 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  24.1 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>