More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1085 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1085  aminotransferase class IV  100 
 
 
294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  29.32 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  34.4 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 
307 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  31.89 
 
 
307 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  34.13 
 
 
320 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  31.21 
 
 
305 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
304 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  34.01 
 
 
318 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 
295 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  31.58 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  31.29 
 
 
304 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
308 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  31.13 
 
 
307 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  25.68 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  32.65 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
317 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  30.61 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  30.6 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3417  branched-chain amino acid aminotransferase  31.39 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  29.27 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  32.42 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  29.86 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  30.82 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  31.21 
 
 
322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  30.69 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  31.6 
 
 
309 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  30.03 
 
 
306 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  30.48 
 
 
295 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  30.48 
 
 
295 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  28.27 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  31.62 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  32.65 
 
 
308 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  31.72 
 
 
339 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  31.27 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  31.06 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  28.28 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  30.79 
 
 
307 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 
282 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  30.51 
 
 
306 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 
307 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  29.07 
 
 
308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4909  aminotransferase class IV  36.3 
 
 
296 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  30.58 
 
 
304 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  31.56 
 
 
307 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  31.08 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
308 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  24.73 
 
 
302 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  29.31 
 
 
308 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 
306 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
316 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  28.81 
 
 
308 aa  107  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  29.23 
 
 
312 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  32.06 
 
 
304 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  30.42 
 
 
309 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  30.38 
 
 
301 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  35.33 
 
 
304 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  30.66 
 
 
310 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
307 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0408  branched-chain amino acid aminotransferase  24.73 
 
 
303 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  29.51 
 
 
288 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  27.3 
 
 
307 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  29.51 
 
 
288 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
304 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  29.66 
 
 
288 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  29.82 
 
 
307 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  29.23 
 
 
312 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  30.31 
 
 
307 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  30.88 
 
 
304 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  30.88 
 
 
304 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  28.18 
 
 
313 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  30.21 
 
 
302 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  29.49 
 
 
307 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 
307 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 
307 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  27.06 
 
 
316 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  29.49 
 
 
306 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 
296 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>