More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4909 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4909  aminotransferase class IV  100 
 
 
296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  39.07 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  42.28 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  35.2 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 
322 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  39.07 
 
 
303 aa  169  5e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  36.52 
 
 
306 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  39.07 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  37.87 
 
 
317 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  34.34 
 
 
318 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  35.49 
 
 
306 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  35.37 
 
 
305 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.69 
 
 
308 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  35.49 
 
 
306 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
306 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  34.64 
 
 
303 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  37.31 
 
 
307 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  37.72 
 
 
306 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 
302 aa  156  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  35.36 
 
 
303 aa  156  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  36.07 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  33.77 
 
 
311 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  31.31 
 
 
304 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
308 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  35.69 
 
 
308 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.59 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  35.54 
 
 
312 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  33.99 
 
 
303 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  35.44 
 
 
308 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  36.58 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  33.8 
 
 
304 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  31.99 
 
 
304 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  33.8 
 
 
304 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  36.11 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 
310 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  34.86 
 
 
309 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
304 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 
307 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  35.94 
 
 
306 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 
307 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  35.07 
 
 
308 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  38.28 
 
 
304 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  36.11 
 
 
308 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.52 
 
 
312 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  34.9 
 
 
307 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  38.28 
 
 
304 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  39.3 
 
 
339 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
306 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  33.79 
 
 
305 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  38.16 
 
 
320 aa  148  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  37.79 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  35.56 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  35.46 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
309 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
309 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
309 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 
307 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
309 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  35.44 
 
 
307 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  36.17 
 
 
307 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
309 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
309 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
309 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  36.68 
 
 
307 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  35.99 
 
 
309 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  34.53 
 
 
304 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
309 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  34.75 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  34.69 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
304 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  35.92 
 
 
307 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  35.4 
 
 
312 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  32.79 
 
 
304 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
304 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  34.49 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  32.79 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  36.17 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  36.17 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 
308 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 
308 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
312 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 
308 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  33.57 
 
 
302 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  35.25 
 
 
307 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 
307 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  36.33 
 
 
309 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  35.09 
 
 
306 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>