139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2686 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2686  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  407  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.531081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3599  hypothetical protein  67.63 
 
 		 209 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3298  hypothetical protein  68.6 
 
 		 209 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3704  hypothetical protein  53.14 
 
 		 214 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4262  hypothetical protein  51.46 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0079  hypothetical protein  50.97 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0074  hypothetical protein  50.81 
 
 		 186 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4434  hypothetical protein  46.49 
 
 		 192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.883018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0634  hypothetical protein  44.83 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2473  hypothetical protein  46.53 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0816  hypothetical protein  47.31 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0731509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0363  hypothetical protein  45.71 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.879459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.02 
 
 		 584 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.51 
 
 		 555 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  39.71 
 
 		 612 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.76 
 
 		 587 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.8 
 
 		 618 aa  108  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3887  hypothetical protein  39.71 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.3 
 
 		 577 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.75 
 
 		 601 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.98 
 
 		 621 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  35.82 
 
 		 586 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  38.57 
 
 		 669 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3993  hypothetical protein  37.75 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.421712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.2 
 
 		 629 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.5 
 
 		 638 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.67 
 
 		 574 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  39.02 
 
 		 595 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.46 
 
 		 710 aa  95.5  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.39 
 
 		 630 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.39 
 
 		 573 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  36.41 
 
 		 590 aa  93.2  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  36.41 
 
 		 635 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  34.53 
 
 		 648 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.85 
 
 		 592 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4032  hypothetical protein  37.02 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  36.11 
 
 		 640 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  35.78 
 
 		 639 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  33.83 
 
 		 596 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.16 
 
 		 620 aa  85.1  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.9 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  35.48 
 
 		 644 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  36.81 
 
 		 637 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  36.45 
 
 		 668 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  36.45 
 
 		 668 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  33.17 
 
 		 615 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.26 
 
 		 637 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  36.45 
 
 		 668 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  36.45 
 
 		 668 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  36.45 
 
 		 668 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  36.45 
 
 		 669 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  36.45 
 
 		 668 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.18 
 
 		 607 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  37.62 
 
 		 623 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.11 
 
 		 629 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.08 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.11 
 
 		 615 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  33.04 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.92 
 
 		 617 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  29.76 
 
 		 611 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  31.97 
 
 		 586 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.84 
 
 		 632 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  32 
 
 		 626 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  31.28 
 
 		 607 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  33.72 
 
 		 595 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  34.74 
 
 		 594 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.53 
 
 		 615 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10991  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.58 
 
 		 673 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.5 
 
 		 599 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.64 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  27.6 
 
 		 637 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.88 
 
 		 591 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  25.68 
 
 		 594 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.96 
 
 		 599 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  25.68 
 
 		 594 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  33.68 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  25 
 
 		 594 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.18 
 
 		 599 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.8 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42028  aminotransferase-like protein  28.65 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.05 
 
 		 635 aa  55.1  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  25.21 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  29.6 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  34.05 
 
 		 283 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0096  aminotransferase, class IV  31.89 
 
 		 273 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.198329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.31 
 
 		 288 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  34.9 
 
 		 280 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  32.98 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  31.86 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  30.41 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  21.46 
 
 		 582 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.22 
 
 		 292 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  34.72 
 
 		 300 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0096  aminotransferase class IV  30.27 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.609842  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  25.12 
 
 		 572 aa  48.5  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1076  anthranilate synthase component I and chorismate binding protein  34.12 
 
 		 91 aa  48.5  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.151096 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  29.89 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  35.8 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  35.51 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>