180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3298 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3298  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3599  hypothetical protein  88.04 
 
 
209 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2686  hypothetical protein  68.6 
 
 
208 aa  275  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.531081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3704  hypothetical protein  54.11 
 
 
214 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4262  hypothetical protein  50.97 
 
 
211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0079  hypothetical protein  50 
 
 
226 aa  191  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0074  hypothetical protein  49.46 
 
 
186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4434  hypothetical protein  50.81 
 
 
192 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.883018  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0634  hypothetical protein  46.34 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2473  hypothetical protein  48.28 
 
 
213 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.08 
 
 
555 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0816  hypothetical protein  47.34 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0731509  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3887  hypothetical protein  40.2 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.05 
 
 
601 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0363  hypothetical protein  48.04 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.879459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3993  hypothetical protein  37.98 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.421712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  40 
 
 
648 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.5 
 
 
621 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4032  hypothetical protein  39.42 
 
 
207 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.45 
 
 
629 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.98 
 
 
592 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.36 
 
 
577 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  39.41 
 
 
595 aa  101  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.45 
 
 
618 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.3 
 
 
553 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  37.5 
 
 
612 aa  99.8  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.14 
 
 
584 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.41 
 
 
587 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  34.33 
 
 
586 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.44 
 
 
574 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.21 
 
 
630 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  40.09 
 
 
594 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  39.42 
 
 
669 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  29.58 
 
 
710 aa  92  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  34.5 
 
 
596 aa  91.7  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  36.32 
 
 
639 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  37.79 
 
 
635 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  34.95 
 
 
590 aa  90.1  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.29 
 
 
638 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.65 
 
 
620 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.04 
 
 
644 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  38.29 
 
 
637 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  35.21 
 
 
615 aa  88.2  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.71 
 
 
637 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.76 
 
 
573 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.75 
 
 
607 aa  84.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  37.23 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  35.35 
 
 
595 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  35.71 
 
 
615 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.22 
 
 
611 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  34.7 
 
 
626 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  32.08 
 
 
607 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.27 
 
 
591 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  37.32 
 
 
623 aa  78.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.63 
 
 
615 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  37.56 
 
 
668 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  37.56 
 
 
668 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  37.56 
 
 
668 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  37.56 
 
 
668 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  37.56 
 
 
668 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  37.56 
 
 
669 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  37.56 
 
 
668 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.39 
 
 
629 aa  75.5  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  35.35 
 
 
640 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.57 
 
 
599 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.99 
 
 
599 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.12 
 
 
635 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  33.94 
 
 
637 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.8 
 
 
632 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.8 
 
 
632 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  26.32 
 
 
244 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.11 
 
 
599 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.98 
 
 
673 aa  68.6  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  24.9 
 
 
594 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  24.48 
 
 
594 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.88 
 
 
617 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  31.03 
 
 
586 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  24.07 
 
 
594 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  26.6 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.11 
 
 
599 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  34.2 
 
 
281 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  29.61 
 
 
572 aa  63.2  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.68 
 
 
288 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.13 
 
 
292 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  34.48 
 
 
283 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.31 
 
 
266 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  28.44 
 
 
271 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  31.86 
 
 
287 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42028  aminotransferase-like protein  28.57 
 
 
294 aa  58.2  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  26.77 
 
 
250 aa  58.2  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10991  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  33.33 
 
 
274 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  31.78 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  26.43 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0673  aminotransferase, class IV  25.93 
 
 
247 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.35 
 
 
271 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  26.55 
 
 
271 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1076  anthranilate synthase component I and chorismate binding protein  38.82 
 
 
91 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.151096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  26.64 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  35.29 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>