184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2473 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2473  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0816  hypothetical protein  96.91 
 
 
194 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0731509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0363  hypothetical protein  79.62 
 
 
225 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.879459 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4434  hypothetical protein  60.73 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.883018  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3298  hypothetical protein  49.75 
 
 
209 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3599  hypothetical protein  48.77 
 
 
209 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2686  hypothetical protein  48.02 
 
 
208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.531081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3704  hypothetical protein  44.93 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0634  hypothetical protein  43.88 
 
 
201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0079  hypothetical protein  39.81 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4262  hypothetical protein  38.76 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0074  hypothetical protein  40.64 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.24 
 
 
577 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3887  hypothetical protein  41.12 
 
 
203 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3993  hypothetical protein  41.71 
 
 
211 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.421712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.83 
 
 
587 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.87 
 
 
592 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  43.22 
 
 
555 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.07 
 
 
574 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  34.34 
 
 
586 aa  94.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.38 
 
 
618 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  33.33 
 
 
629 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4032  hypothetical protein  41.12 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  37.25 
 
 
612 aa  92  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.35 
 
 
584 aa  91.7  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.93 
 
 
553 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.82 
 
 
710 aa  90.5  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  34.67 
 
 
596 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  35.38 
 
 
595 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  35.38 
 
 
595 aa  86.3  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.29 
 
 
573 aa  84.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.33 
 
 
611 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  36 
 
 
615 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  31.78 
 
 
590 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.27 
 
 
599 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.87 
 
 
601 aa  82  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  39.6 
 
 
594 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.49 
 
 
630 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37 
 
 
599 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.49 
 
 
635 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.5 
 
 
591 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.56 
 
 
621 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  36.32 
 
 
669 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.15 
 
 
617 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  33.78 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  32.46 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  34.78 
 
 
648 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.78 
 
 
599 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  29.86 
 
 
607 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.39 
 
 
629 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.65 
 
 
620 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  33.63 
 
 
644 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  34.92 
 
 
635 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  34.53 
 
 
626 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  35.26 
 
 
639 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.07 
 
 
638 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  36.32 
 
 
623 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.29 
 
 
599 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  35.08 
 
 
637 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.79 
 
 
637 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.18 
 
 
607 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  26.46 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  33.33 
 
 
668 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  33.33 
 
 
668 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  30 
 
 
637 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  33.33 
 
 
668 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  33.33 
 
 
668 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  33.33 
 
 
668 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  33.33 
 
 
669 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  33.33 
 
 
668 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  21.81 
 
 
594 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  21.4 
 
 
594 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  20.99 
 
 
594 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.02 
 
 
673 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.59 
 
 
632 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  33.03 
 
 
640 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  28.85 
 
 
615 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.36 
 
 
632 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.44 
 
 
292 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  30.56 
 
 
615 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  21.89 
 
 
572 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  34.5 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10991  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0673  aminotransferase, class IV  32.14 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0179  aminotransferase class IV  28.35 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.613423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  23.76 
 
 
571 aa  52.4  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  29.07 
 
 
252 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  37.36 
 
 
281 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  29.61 
 
 
280 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  25.79 
 
 
586 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  26.73 
 
 
311 aa  49.7  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.4 
 
 
277 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  26.32 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0408  branched-chain amino acid aminotransferase  22.42 
 
 
303 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.88 
 
 
290 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  38.89 
 
 
307 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  23.97 
 
 
271 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  30.23 
 
 
244 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  25.89 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.23 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>