34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3619 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3619  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  550  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2622  putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.55 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2314  aminotransferase class IV  38.91 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  29.57 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  22.89 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  24.9 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.44 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  28.69 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  25.5 
 
 		 741 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  30.77 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  31.58 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  24.89 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  27.51 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  23.63 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.03 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  26.92 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04770  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  26.78 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0255  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.88 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  20.42 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  29.5 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  26.7 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2383  aminotransferase class IV  23.43 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  22.89 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  21.95 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.22 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  20.9 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  25.64 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  22.27 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  22.27 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.75 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1383  aminotransferase class IV  24.24 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.0488839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  25.63 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  24.3 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>