296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3563 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  100 
 
 		 262 aa  522  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  47.1 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  48.29 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  44.7 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  42.8 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  38.39 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.93 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  39.08 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  36.29 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  34.3 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  37 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  33.88 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  37.1 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  32.7 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  32.01 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  30.53 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  28.76 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  30.89 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  27.45 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  30.33 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  28.79 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  30.33 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  22.4 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  27.94 
 
 		 588 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  26.17 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  21.6 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  32.06 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.35 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  24.26 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  24.26 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.85 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  24.68 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.85 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.85 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.85 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  26.46 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  21.9 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  27.57 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  25.7 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  31.11 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  25.7 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  33.59 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  32.77 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  35.71 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  31.54 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  24.02 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  31.85 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.92 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.34 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  24.65 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  25.42 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  26.69 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  26.69 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  24.14 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  24.14 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  32.77 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  25.35 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  25.35 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  25.35 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  25.35 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  25.35 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  25.35 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  32.56 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  35.96 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  25.35 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  31.11 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  25.2 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  25.32 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  35.96 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  24.81 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  23.85 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  20.65 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  28.17 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  27.34 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  37.11 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  29.41 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1215  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2876  aminotransferase, class IV  27.59 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  23.81 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  23.71 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  29.82 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  28.5 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  34.96 
 
 		 296 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>