77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2622 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2622  putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2314  aminotransferase class IV  60.16 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3619  hypothetical protein  38.55 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.92 
 
 		 741 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  30 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  22.08 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.42 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  24.23 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  25.68 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.06 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.09 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.15 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  25.59 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  25 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  22.63 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.08 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.9 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  25.66 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.98 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  22.94 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.78 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.11 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  27.27 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  25.21 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.46 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  23.55 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  24.61 
 
 		 309 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  26.87 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  28.25 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  23.89 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  27.2 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2383  aminotransferase class IV  28.51 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.98 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.29 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.43 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  24.1 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.35 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  24.1 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  24.71 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.61 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  25.31 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  24.36 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.52 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.72 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.98 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.34 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.17 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  22.91 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.34 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  25 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  29.06 
 
 		 296 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  23.55 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  27.92 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  22.65 
 
 		 300 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  25.7 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1107  aminotransferase class IV  28.12 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.0333795 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0434  hypothetical protein  29.89 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.422566  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  24.58 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1202  aminotransferase class IV  31.11 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  25.94 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.21 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.55 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.12 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  29.68 
 
 		 632 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  25.12 
 
 		 615 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3993  hypothetical protein  28.83 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.421712  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.85 
 
 		 607 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  26.5 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  25.1 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.65 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  22.01 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  22.01 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  23.41 
 
 		 290 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0096  aminotransferase, class IV  19.42 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.198329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.9 
 
 		 282 aa  42  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>