45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0049 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  49.43 
 
 		 265 aa  259  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  48.85 
 
 		 270 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  39.21 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  34.19 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  39.08 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  38.57 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  40.87 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  37.61 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  33.92 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  32.73 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.78 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  33.47 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  33.74 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  34.94 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  34.55 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  32.38 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1802  aminotransferase class IV  27.62 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.71 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  30.57 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  32 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  26.98 
 
 		 292 aa  48.9  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  27.7 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  33.8 
 
 		 623 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  22.63 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2314  aminotransferase class IV  27.83 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  26.72 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2622  putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.92 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  28.69 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 		 322 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  26.02 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.75 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  30.32 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  25.1 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  28.57 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  23.17 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  23.55 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  27.67 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  28.26 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  29.95 
 
 		 618 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  30.04 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  24.71 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>