180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0949 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  96.43 
 
 		 560 aa  837    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 560 aa  1090    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  65.76 
 
 		 562 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  46.17 
 
 		 529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  43.66 
 
 		 521 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.34 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  43.1 
 
 		 545 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  45.78 
 
 		 539 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.38 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  43.93 
 
 		 542 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.39 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  43.75 
 
 		 641 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  45.35 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.71 
 
 		 530 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  43.97 
 
 		 536 aa  350  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.09 
 
 		 575 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  41.96 
 
 		 540 aa  346  8e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  42.49 
 
 		 538 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.39 
 
 		 530 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  42.08 
 
 		 542 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.59 
 
 		 551 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  35.12 
 
 		 543 aa  323  7e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  44.21 
 
 		 550 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.97 
 
 		 539 aa  321  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.93 
 
 		 534 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 534 aa  316  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.35 
 
 		 575 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 506 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.4 
 
 		 575 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  36.23 
 
 		 565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.53 
 
 		 506 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.17 
 
 		 575 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 556 aa  306  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.15 
 
 		 560 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.82 
 
 		 529 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.97 
 
 		 560 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  34.64 
 
 		 559 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.97 
 
 		 560 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.67 
 
 		 547 aa  299  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.23 
 
 		 570 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 554 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.43 
 
 		 541 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 507 aa  293  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  39.2 
 
 		 506 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  37.98 
 
 		 519 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  34.61 
 
 		 574 aa  280  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  36.23 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  38.68 
 
 		 506 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  40.04 
 
 		 627 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  40.22 
 
 		 476 aa  257  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 571 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  37.9 
 
 		 553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.98 
 
 		 557 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  32.66 
 
 		 519 aa  204  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  31.01 
 
 		 559 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.64 
 
 		 559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 559 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.33 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.48 
 
 		 525 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.27 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  26.48 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  28.6 
 
 		 540 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  26.45 
 
 		 543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  26.59 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.83 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.17 
 
 		 539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.58 
 
 		 518 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.44 
 
 		 539 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  27.21 
 
 		 519 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.39 
 
 		 529 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  24.8 
 
 		 497 aa  99.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  24.3 
 
 		 547 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  22.52 
 
 		 546 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  25.28 
 
 		 555 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.84 
 
 		 374 aa  93.6  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  26.08 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.87 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.62 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  26.06 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  23.91 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  25.66 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  25.18 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  25.12 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  26.84 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  25.51 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  24.15 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  26.92 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 376 aa  67  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  27.87 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  24.38 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  27.62 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  23.37 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  25.06 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  21.56 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  25.84 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  26.68 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  26.68 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  22.28 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>