231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3923 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  809    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  74.47 
 
 		 398 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  71.72 
 
 		 403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  70.13 
 
 		 411 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  68.38 
 
 		 403 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  72.3 
 
 		 407 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  67.51 
 
 		 397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  67.51 
 
 		 397 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  68.06 
 
 		 397 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  68.34 
 
 		 397 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.58 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.9 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.9 
 
 		 389 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2394  PepSY-associated TM helix  41.33 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  40.32 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.9 
 
 		 390 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  38.73 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.05 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.79 
 
 		 389 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  27.3 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  28.03 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  26.6 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.73 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  24.87 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  26.99 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  26.6 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  24.87 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  24.13 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  25.13 
 
 		 371 aa  96.7  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0817  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.5 
 
 		 386 aa  92.8  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.77 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  23.44 
 
 		 377 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  24.1 
 
 		 377 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  24.64 
 
 		 351 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  23.1 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1435  PepSY-associated membrane protein  28.68 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  25.14 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  24.17 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3008  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.81 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2723  putative iron-regulated membrane protein  26.1 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.46 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.63 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.02 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  25.38 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.2 
 
 		 526 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2069  PepSY-associated TM helix domain protein  24.82 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  27.04 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1737  hypothetical protein  25.56 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  20.61 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  23.08 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  24.23 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.6 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.69 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  24.53 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  24.13 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.09 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.27 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  20 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  24.74 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  24.27 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3271  PepSY-associated TM helix  25.78 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  23.58 
 
 		 529 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.58 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  23.75 
 
 		 627 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  21.83 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  23.91 
 
 		 542 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3894  PepSY-associated TM helix domain protein  25.47 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  23.08 
 
 		 543 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  23.75 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  26.14 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  24.65 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.86 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.62 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  21.55 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  22.74 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.62 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  24.35 
 
 		 524 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  23.73 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  20.92 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  23.12 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  23.19 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.58 
 
 		 530 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.66 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  23.04 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  24 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  22.84 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  22.4 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  22.78 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  23.06 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.38 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.78 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  23.51 
 
 		 538 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  22.7 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  23.95 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  26.12 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.7 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  21.39 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>