147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36970 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 
553 aa  1108    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  49.45 
 
 
506 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  50.46 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  42.58 
 
 
529 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  39.82 
 
 
521 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.41 
 
 
526 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.18 
 
 
525 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.57 
 
 
525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  37.57 
 
 
641 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  36.81 
 
 
539 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.9 
 
 
575 aa  292  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  38.95 
 
 
538 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  39.8 
 
 
524 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.57 
 
 
530 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.06 
 
 
530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  36.42 
 
 
542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  38.77 
 
 
550 aa  282  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  36.96 
 
 
536 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  34.18 
 
 
545 aa  279  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  34.45 
 
 
540 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.23 
 
 
539 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.82 
 
 
554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  35.07 
 
 
542 aa  267  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.52 
 
 
571 aa  266  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  34.43 
 
 
519 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.05 
 
 
575 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.47 
 
 
556 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.88 
 
 
575 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.09 
 
 
562 aa  262  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.85 
 
 
570 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.58 
 
 
575 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.3 
 
 
560 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  34.98 
 
 
627 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.3 
 
 
560 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  37 
 
 
476 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  30.7 
 
 
565 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.66 
 
 
560 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  29.54 
 
 
559 aa  256  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.4 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  29.53 
 
 
543 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32 
 
 
534 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.12 
 
 
534 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.79 
 
 
547 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  37.74 
 
 
506 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  32.74 
 
 
529 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.79 
 
 
551 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.87 
 
 
541 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  32.63 
 
 
559 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.59 
 
 
529 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  35.89 
 
 
506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  31.14 
 
 
574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.62 
 
 
559 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.42 
 
 
559 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  31.65 
 
 
519 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.33 
 
 
557 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  47.84 
 
 
560 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  47.41 
 
 
560 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.94 
 
 
533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.48 
 
 
525 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  27.17 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  24.57 
 
 
543 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.79 
 
 
518 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.5 
 
 
501 aa  91.3  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  27.89 
 
 
497 aa  89  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  29.21 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.09 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  22.47 
 
 
496 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  30.53 
 
 
534 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  21.93 
 
 
547 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.09 
 
 
525 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  25.26 
 
 
527 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  21.3 
 
 
546 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.42 
 
 
539 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.42 
 
 
539 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  23.66 
 
 
539 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.37 
 
 
374 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  30.99 
 
 
539 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.32 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.5 
 
 
540 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  27.05 
 
 
502 aa  70.5  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  24.24 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  25.06 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  25.77 
 
 
503 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.77 
 
 
503 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  23.13 
 
 
403 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  29.58 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  24.69 
 
 
377 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.32 
 
 
411 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  27.67 
 
 
396 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.03 
 
 
503 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  27.78 
 
 
555 aa  60.8  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  23.86 
 
 
411 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
412 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  21.59 
 
 
398 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  25.81 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.51 
 
 
412 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  24.73 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 
1117 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  25.81 
 
 
410 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.55 
 
 
425 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>