213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2775 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 393 aa  789    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  68.62 
 
 		 405 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.53 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  30.05 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  30.58 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.47 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  28.43 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  30.21 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  28.85 
 
 		 408 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.47 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  27.95 
 
 		 428 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  29.95 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  28.68 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  27.57 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3317  PepSY-associated TM helix domain protein  27.7 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00586385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.49 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.33 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  26.63 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  26.57 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.78 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  24.8 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  26.76 
 
 		 439 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  25.45 
 
 		 380 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  27.29 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.06 
 
 		 842 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  28.08 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  27.27 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  28.31 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  24.25 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  27.74 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  24.62 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  22.65 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  27.93 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  24.94 
 
 		 360 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1822  hypothetical protein  25.12 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.3 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  26.13 
 
 		 472 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.08 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.87 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32750  hypothetical protein  27.02 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196352  hitchhiker  0.0000232684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  28.28 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0028  PepSY-associated TM helix  27.49 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522005  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  27.6 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  20.92 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.81 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  26.05 
 
 		 783 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.58 
 
 		 844 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.66 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  24.36 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.76 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  27.05 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  27.05 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.31 
 
 		 850 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  26.14 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.34 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.56 
 
 		 850 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.81 
 
 		 849 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  21.88 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  25.53 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  22.86 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  23.6 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  23.85 
 
 		 850 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.8 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.63 
 
 		 840 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  26.76 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  27.18 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.98 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  24.04 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.56 
 
 		 851 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  25.75 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0769  PepSY-associated TM helix domain protein  28.42 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  23.33 
 
 		 850 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.25 
 
 		 849 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.39 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  24.49 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  24.81 
 
 		 844 aa  73.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.3 
 
 		 840 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.06 
 
 		 885 aa  73.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  21.39 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.87 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  22.64 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  25.59 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.91 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.9 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.88 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  23.69 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.28 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  21.59 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  25.41 
 
 		 822 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  23.28 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  23.12 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  24.94 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.77 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.62 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.48 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>