140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0109 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
534 aa  1106    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  85.39 
 
 
529 aa  904    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  97.38 
 
 
534 aa  1055    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.57 
 
 
554 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.65 
 
 
575 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.76 
 
 
560 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.74 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  44.81 
 
 
559 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.76 
 
 
560 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  46.08 
 
 
565 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.76 
 
 
560 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.27 
 
 
575 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.9 
 
 
575 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.19 
 
 
570 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.47 
 
 
556 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.65 
 
 
541 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  44.99 
 
 
542 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  42 
 
 
574 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  43.95 
 
 
545 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  42.75 
 
 
519 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  38.56 
 
 
543 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.2 
 
 
530 aa  359  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.54 
 
 
530 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  39.5 
 
 
521 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  43.14 
 
 
538 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.05 
 
 
575 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  39.62 
 
 
529 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  41.67 
 
 
550 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.43 
 
 
525 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.79 
 
 
539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  38.29 
 
 
524 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.82 
 
 
525 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  39.24 
 
 
539 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  36.66 
 
 
641 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.29 
 
 
551 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  37.68 
 
 
536 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.69 
 
 
526 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  37.31 
 
 
540 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  37.78 
 
 
542 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.23 
 
 
507 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.53 
 
 
562 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  36.88 
 
 
506 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.62 
 
 
506 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.17 
 
 
506 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  35.64 
 
 
506 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  31.26 
 
 
529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  33.09 
 
 
627 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  36.79 
 
 
560 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  32 
 
 
553 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  32.75 
 
 
476 aa  224  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.42 
 
 
560 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.15 
 
 
571 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  30.04 
 
 
519 aa  200  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.67 
 
 
557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  27.16 
 
 
559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.16 
 
 
559 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.16 
 
 
559 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.59 
 
 
525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  26.5 
 
 
543 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.68 
 
 
533 aa  148  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  25.71 
 
 
540 aa  124  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  26.27 
 
 
519 aa  124  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.32 
 
 
518 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  22.12 
 
 
534 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  21.56 
 
 
546 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.93 
 
 
525 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  24 
 
 
547 aa  99.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.77 
 
 
529 aa  96.7  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  26.24 
 
 
555 aa  91.3  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.61 
 
 
539 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  20.85 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.84 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.08 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  25.47 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  21.36 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.11 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.63 
 
 
501 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  23.85 
 
 
503 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.85 
 
 
503 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.01 
 
 
503 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  24.8 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  22.55 
 
 
504 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  25 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  24.2 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  24.2 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  24.2 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.65 
 
 
540 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  21.03 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  24.06 
 
 
503 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  21.03 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  21.8 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  23.5 
 
 
398 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  22.96 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  21.52 
 
 
391 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  22.74 
 
 
377 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  24.8 
 
 
371 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  24.16 
 
 
356 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.34 
 
 
376 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  25.79 
 
 
377 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  23.64 
 
 
377 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>