233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3918 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
374 aa  743    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  66.12 
 
 
387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.62 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  28.8 
 
 
539 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  29.27 
 
 
542 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  27.25 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.65 
 
 
575 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  31.55 
 
 
519 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  27.42 
 
 
497 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  28.23 
 
 
380 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  28 
 
 
399 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  27.39 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  29.11 
 
 
519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.46 
 
 
533 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  28.39 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  27.65 
 
 
351 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.8 
 
 
525 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  27.76 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  31.65 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  26.63 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.65 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.65 
 
 
503 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  24.87 
 
 
543 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  28.69 
 
 
538 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  29.78 
 
 
529 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  27.07 
 
 
397 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.57 
 
 
525 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.05 
 
 
530 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.15 
 
 
554 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  30.4 
 
 
504 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  26.45 
 
 
641 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.39 
 
 
530 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.85 
 
 
525 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  27.42 
 
 
403 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  29.81 
 
 
542 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.91 
 
 
526 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  27.59 
 
 
397 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  27.15 
 
 
397 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.02 
 
 
539 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  30.73 
 
 
503 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  25.67 
 
 
496 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.93 
 
 
518 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  26.26 
 
 
397 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  27.27 
 
 
506 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  30.25 
 
 
555 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.13 
 
 
570 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.42 
 
 
575 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  27 
 
 
506 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.24 
 
 
389 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  23.88 
 
 
371 aa  99.4  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.47 
 
 
540 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  27.03 
 
 
377 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  26.97 
 
 
559 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  25.33 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  28.42 
 
 
504 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  28.42 
 
 
504 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  28.42 
 
 
504 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  22.7 
 
 
389 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.89 
 
 
575 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  25.38 
 
 
540 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.17 
 
 
506 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.97 
 
 
389 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  25.72 
 
 
565 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.23 
 
 
541 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.07 
 
 
390 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  24.2 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.65 
 
 
560 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.9 
 
 
560 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.63 
 
 
575 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.27 
 
 
560 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.49 
 
 
506 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.78 
 
 
534 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.75 
 
 
547 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  24.57 
 
 
547 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.94 
 
 
539 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  22.68 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.49 
 
 
534 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  26.41 
 
 
527 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.18 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  22.43 
 
 
539 aa  90.5  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.67 
 
 
525 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  24.08 
 
 
534 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.02 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  23.86 
 
 
361 aa  89.7  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.22 
 
 
539 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  26.82 
 
 
356 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  24.61 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.31 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  23.02 
 
 
539 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  25.14 
 
 
524 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  26.04 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  20.81 
 
 
389 aa  87  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  27.96 
 
 
502 aa  86.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.7 
 
 
557 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  23.2 
 
 
543 aa  86.3  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  27.04 
 
 
529 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.32 
 
 
529 aa  86.3  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.04 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  27.04 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.75 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>