150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2728 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  75.67 
 
 
559 aa  894    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  73.89 
 
 
560 aa  882    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  73.89 
 
 
560 aa  883    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  74.07 
 
 
560 aa  884    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  79.29 
 
 
575 aa  944    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  59.42 
 
 
541 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  78.94 
 
 
565 aa  942    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
554 aa  1147    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  79.65 
 
 
575 aa  950    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  58.45 
 
 
556 aa  660    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  58.06 
 
 
547 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  79.47 
 
 
575 aa  949    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  56.04 
 
 
570 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  48.93 
 
 
574 aa  544  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  53.51 
 
 
519 aa  522  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.57 
 
 
534 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.46 
 
 
534 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.85 
 
 
529 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  42.12 
 
 
542 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  40.12 
 
 
545 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  40.79 
 
 
538 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.79 
 
 
530 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.79 
 
 
530 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.28 
 
 
575 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  37.64 
 
 
521 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.63 
 
 
539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  38.32 
 
 
529 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  34.31 
 
 
543 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  36.35 
 
 
536 aa  341  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.21 
 
 
525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.4 
 
 
525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.65 
 
 
526 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  37.42 
 
 
539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  35.93 
 
 
641 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  37.06 
 
 
540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.55 
 
 
551 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  35.81 
 
 
542 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  36.22 
 
 
550 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  35.01 
 
 
524 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.97 
 
 
506 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.49 
 
 
506 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.9 
 
 
562 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.69 
 
 
507 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  34.23 
 
 
506 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  33.16 
 
 
627 aa  266  5.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  34.6 
 
 
476 aa  260  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  32.96 
 
 
506 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  33.68 
 
 
553 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  34.69 
 
 
560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  30.26 
 
 
529 aa  227  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.71 
 
 
571 aa  220  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.88 
 
 
560 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.25 
 
 
557 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  27.55 
 
 
519 aa  183  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  26.37 
 
 
559 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.6 
 
 
559 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.2 
 
 
559 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.51 
 
 
533 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.77 
 
 
525 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  25.53 
 
 
543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  26.55 
 
 
540 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.7 
 
 
518 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  24.03 
 
 
519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  25.7 
 
 
547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  24.27 
 
 
546 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  26.49 
 
 
496 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  23.69 
 
 
534 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.65 
 
 
525 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.31 
 
 
529 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  23.26 
 
 
527 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.18 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  24 
 
 
555 aa  97.8  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.86 
 
 
539 aa  94  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.51 
 
 
539 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  24.87 
 
 
497 aa  90.1  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  21.51 
 
 
539 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.72 
 
 
387 aa  87.4  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  21.81 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.59 
 
 
540 aa  84  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.68 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  25.35 
 
 
502 aa  74.7  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  22.84 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.16 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  22.27 
 
 
503 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.27 
 
 
503 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  23.97 
 
 
503 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  21.53 
 
 
398 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.95 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.64 
 
 
503 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  22.53 
 
 
408 aa  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  24.15 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  23.13 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  26.42 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.19 
 
 
389 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  21.85 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  24.15 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.12 
 
 
382 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.92 
 
 
389 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  21.52 
 
 
405 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  22.31 
 
 
399 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>