142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4431 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  97.38 
 
 
534 aa  1061    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  85.58 
 
 
529 aa  904    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
534 aa  1105    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.46 
 
 
554 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.85 
 
 
575 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.3 
 
 
547 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  45.19 
 
 
559 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.14 
 
 
560 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.14 
 
 
560 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.14 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  46.08 
 
 
565 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.27 
 
 
575 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.1 
 
 
575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.57 
 
 
570 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.93 
 
 
556 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.93 
 
 
541 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  44.88 
 
 
542 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  41.83 
 
 
574 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  43.87 
 
 
545 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  43.19 
 
 
519 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  39.43 
 
 
543 aa  364  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.98 
 
 
530 aa  359  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.94 
 
 
575 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.54 
 
 
530 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  40 
 
 
529 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  42.7 
 
 
538 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  39.69 
 
 
521 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  42.05 
 
 
550 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38 
 
 
525 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  39.09 
 
 
524 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.79 
 
 
539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.57 
 
 
525 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  38.71 
 
 
539 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  37.62 
 
 
641 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.66 
 
 
551 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  38.13 
 
 
536 aa  322  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.15 
 
 
526 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  37.36 
 
 
540 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  37.78 
 
 
542 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40 
 
 
507 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.53 
 
 
562 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.62 
 
 
506 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.17 
 
 
506 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  36.69 
 
 
506 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  35.64 
 
 
506 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  31.32 
 
 
529 aa  256  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  33.27 
 
 
627 aa  249  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  37.18 
 
 
560 aa  249  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  32.12 
 
 
553 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  33.01 
 
 
476 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.81 
 
 
560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  30.02 
 
 
519 aa  203  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.51 
 
 
571 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.02 
 
 
557 aa  200  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  27.48 
 
 
559 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.66 
 
 
559 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.66 
 
 
559 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.81 
 
 
525 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  26.97 
 
 
543 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.32 
 
 
533 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  26.1 
 
 
540 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  26.23 
 
 
519 aa  123  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.2 
 
 
518 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  23.38 
 
 
534 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.19 
 
 
525 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  21.96 
 
 
546 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  23.06 
 
 
547 aa  100  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  26.67 
 
 
555 aa  97.1  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.22 
 
 
529 aa  91.3  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  20.51 
 
 
539 aa  86.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.88 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.81 
 
 
539 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  21.8 
 
 
539 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  25.47 
 
 
496 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.68 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.12 
 
 
501 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.58 
 
 
539 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.14 
 
 
540 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  24.93 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  23.55 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  25.23 
 
 
502 aa  74.7  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  23.15 
 
 
503 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.15 
 
 
503 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.28 
 
 
503 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  24.09 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  24.09 
 
 
504 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  24.09 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  21.1 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  23.44 
 
 
503 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  21.03 
 
 
408 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  20.78 
 
 
408 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  21.81 
 
 
398 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  23 
 
 
377 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  22.22 
 
 
399 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  21.57 
 
 
391 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.34 
 
 
376 aa  57.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  25.79 
 
 
377 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  21.93 
 
 
527 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  24.8 
 
 
371 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  22.72 
 
 
356 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.715022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>