161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0147 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
507 aa  992    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  57.14 
 
 
539 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  54.88 
 
 
530 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  54.78 
 
 
538 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  55.1 
 
 
530 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  42.8 
 
 
545 aa  359  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  45.85 
 
 
542 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  40.45 
 
 
529 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.04 
 
 
575 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  38.57 
 
 
521 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.4 
 
 
525 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  42.7 
 
 
539 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  41.65 
 
 
524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.4 
 
 
534 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.46 
 
 
526 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.18 
 
 
534 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.58 
 
 
525 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  40.09 
 
 
641 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.78 
 
 
529 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  41.57 
 
 
536 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  40.38 
 
 
540 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.08 
 
 
562 aa  310  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  35.8 
 
 
559 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  42.44 
 
 
476 aa  307  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  40.71 
 
 
542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.19 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.55 
 
 
554 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.5 
 
 
575 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.5 
 
 
575 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  36.5 
 
 
565 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.69 
 
 
575 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.7 
 
 
560 aa  295  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.29 
 
 
560 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.8 
 
 
506 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.21 
 
 
556 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  38.96 
 
 
550 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.29 
 
 
560 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.4 
 
 
506 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  34.92 
 
 
543 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.48 
 
 
541 aa  286  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.08 
 
 
570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.53 
 
 
551 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  34.19 
 
 
574 aa  261  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  34.93 
 
 
506 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  36.34 
 
 
627 aa  256  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  42.92 
 
 
560 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  36.94 
 
 
553 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  35.69 
 
 
519 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  36.45 
 
 
506 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.25 
 
 
560 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.48 
 
 
571 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  31.83 
 
 
529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  33.26 
 
 
519 aa  217  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  30.98 
 
 
559 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.98 
 
 
559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.77 
 
 
559 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.08 
 
 
557 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.43 
 
 
525 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.52 
 
 
533 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  27.07 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  29.59 
 
 
519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.46 
 
 
518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  28.26 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  25.48 
 
 
497 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  27.15 
 
 
496 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  27.75 
 
 
527 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.84 
 
 
539 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.47 
 
 
539 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  22.89 
 
 
546 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  25.78 
 
 
539 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  24.69 
 
 
539 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  26.35 
 
 
502 aa  91.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  24.89 
 
 
555 aa  89.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.82 
 
 
540 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.53 
 
 
374 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  29.78 
 
 
504 aa  87.4  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  31.06 
 
 
504 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  31.06 
 
 
504 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  31.06 
 
 
504 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  24.23 
 
 
547 aa  84  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  23.13 
 
 
534 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.89 
 
 
525 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.17 
 
 
529 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.14 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  28.26 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.26 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.5 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  22.42 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.87 
 
 
503 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.85 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  24.93 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  26.33 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.46 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  23.2 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.62 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  24.19 
 
 
407 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  25.14 
 
 
370 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  26.83 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.54 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  27.97 
 
 
503 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>