158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0946 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  100 
 
 
502 aa  1002    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.95 
 
 
501 aa  300  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  36.5 
 
 
496 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  33.99 
 
 
497 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  27.97 
 
 
506 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  27.78 
 
 
506 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  25.4 
 
 
641 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.37 
 
 
506 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.5 
 
 
506 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  27.51 
 
 
521 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  26.41 
 
 
527 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.12 
 
 
525 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
525 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.92 
 
 
526 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  26.19 
 
 
529 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.26 
 
 
525 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.64 
 
 
533 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.78 
 
 
562 aa  97.8  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  28.33 
 
 
538 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  27.11 
 
 
540 aa  93.2  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  26.92 
 
 
543 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  27.04 
 
 
542 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  26.23 
 
 
519 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  26.13 
 
 
536 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  25.14 
 
 
503 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.14 
 
 
503 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.74 
 
 
530 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.98 
 
 
530 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.86 
 
 
503 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  24.79 
 
 
543 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.2 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.83 
 
 
539 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  29.21 
 
 
627 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.88 
 
 
507 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
575 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  25.93 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  25.43 
 
 
565 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.96 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.22 
 
 
575 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  26.13 
 
 
539 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.17 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.22 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  25.61 
 
 
550 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.7 
 
 
559 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.08 
 
 
385 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.48 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.15 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  32.7 
 
 
559 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
534 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  24.1 
 
 
503 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  24.42 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.23 
 
 
559 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.23 
 
 
534 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  26.91 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.4 
 
 
554 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  26.21 
 
 
540 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  24.14 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  23.6 
 
 
504 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.1 
 
 
389 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  24.23 
 
 
380 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  27.02 
 
 
555 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  26.38 
 
 
519 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.55 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.87 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  23.82 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  24.4 
 
 
519 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  23.44 
 
 
574 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  22.13 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.44 
 
 
560 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  23.34 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.51 
 
 
556 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.04 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  24.73 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.04 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.69 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.71 
 
 
547 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  22.05 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  23.53 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.87 
 
 
560 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.93 
 
 
382 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.21 
 
 
539 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  21.49 
 
 
407 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  23.55 
 
 
546 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.85 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  24.87 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.28 
 
 
386 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  24.61 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  22.02 
 
 
411 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  22.19 
 
 
403 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.2 
 
 
370 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  22.6 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  21.91 
 
 
399 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  23.45 
 
 
371 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.7 
 
 
539 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.47 
 
 
541 aa  63.9  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
370 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  24.55 
 
 
381 aa  63.9  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  24.16 
 
 
529 aa  63.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.11 
 
 
529 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  22.68 
 
 
539 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>