138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4291 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  85.39 
 
 		 534 aa  933    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 529 aa  1091    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  85.58 
 
 		 534 aa  925    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.6 
 
 		 575 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  44.65 
 
 		 559 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.85 
 
 		 554 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.49 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.09 
 
 		 560 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  45.85 
 
 		 565 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.04 
 
 		 575 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.91 
 
 		 560 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.75 
 
 		 575 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  47.39 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.91 
 
 		 560 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.63 
 
 		 541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.28 
 
 		 570 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  44.25 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  43.66 
 
 		 574 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  44.25 
 
 		 519 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  43.44 
 
 		 545 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  39.48 
 
 		 543 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  41.06 
 
 		 529 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.34 
 
 		 575 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.59 
 
 		 525 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  42.73 
 
 		 538 aa  349  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.35 
 
 		 530 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  39.02 
 
 		 521 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.13 
 
 		 530 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  39.88 
 
 		 536 aa  334  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.72 
 
 		 525 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  38.29 
 
 		 524 aa  329  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  38.37 
 
 		 539 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 539 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  37.45 
 
 		 641 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.78 
 
 		 526 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  39.92 
 
 		 550 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.69 
 
 		 551 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  36.07 
 
 		 540 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  36.31 
 
 		 542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.78 
 
 		 507 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.18 
 
 		 506 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.98 
 
 		 506 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  35.17 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  34.13 
 
 		 627 aa  263  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  34.69 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  32.6 
 
 		 529 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  37.28 
 
 		 560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  33.33 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  31.52 
 
 		 553 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.2 
 
 		 560 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  30.43 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.29 
 
 		 571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.46 
 
 		 557 aa  193  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  26.6 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.11 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.94 
 
 		 559 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.54 
 
 		 525 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  26.13 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.9 
 
 		 533 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  27.42 
 
 		 519 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  25.19 
 
 		 540 aa  120  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.28 
 
 		 518 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  22.86 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.95 
 
 		 525 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  22.22 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  22.88 
 
 		 546 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.14 
 
 		 529 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  21.45 
 
 		 539 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.9 
 
 		 539 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.99 
 
 		 539 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  24.09 
 
 		 555 aa  88.2  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  24 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.51 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  24.66 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.65 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  24.11 
 
 		 502 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  24.4 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  24.37 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.89 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  24.58 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  24.23 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  24.23 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  24.23 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  23.37 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  23.32 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  24.07 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  22.74 
 
 		 397 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  22.56 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  22.82 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  24.8 
 
 		 371 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  22.51 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  22.61 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  23.12 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  23.37 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  22.82 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  22.99 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>