240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3639 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
387 aa  769    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  66.31 
 
 
374 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.38 
 
 
501 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  30.31 
 
 
539 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  27.84 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  28.03 
 
 
543 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  27.95 
 
 
641 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.15 
 
 
525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  29.27 
 
 
542 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.11 
 
 
525 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.27 
 
 
533 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  28.87 
 
 
519 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.03 
 
 
526 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  28.57 
 
 
538 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  28.42 
 
 
529 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.17 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  27.82 
 
 
540 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  26.15 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.75 
 
 
575 aa  116  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.48 
 
 
570 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  27.27 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  30.13 
 
 
542 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  28.5 
 
 
559 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  27.7 
 
 
397 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.61 
 
 
554 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  27.08 
 
 
403 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  27.56 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  30.97 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  27.6 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.22 
 
 
530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.55 
 
 
530 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.58 
 
 
503 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  28.16 
 
 
397 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  26.52 
 
 
497 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  31.22 
 
 
503 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.22 
 
 
503 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  26.39 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  27.25 
 
 
540 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  27.18 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.02 
 
 
575 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.91 
 
 
560 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.17 
 
 
560 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  28.72 
 
 
565 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.05 
 
 
539 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.91 
 
 
560 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.51 
 
 
534 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  26.43 
 
 
407 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  27.23 
 
 
536 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  30 
 
 
503 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.87 
 
 
575 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  26.07 
 
 
411 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  28.31 
 
 
504 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.42 
 
 
562 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  28.03 
 
 
524 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.87 
 
 
575 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.81 
 
 
534 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.36 
 
 
525 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.18 
 
 
506 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  28.26 
 
 
506 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  27.05 
 
 
534 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  26.37 
 
 
371 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.91 
 
 
506 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  24.66 
 
 
543 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  26.61 
 
 
351 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.2 
 
 
389 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.05 
 
 
540 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  25.18 
 
 
574 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.63 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  27.72 
 
 
506 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  29.14 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.91 
 
 
389 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  26.84 
 
 
550 aa  97.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.06 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.06 
 
 
557 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.34 
 
 
518 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  26.88 
 
 
555 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.1 
 
 
389 aa  94  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  23.02 
 
 
539 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.77 
 
 
386 aa  93.2  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  26.78 
 
 
504 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  26.78 
 
 
504 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  26.78 
 
 
504 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.13 
 
 
541 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  27.45 
 
 
521 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.81 
 
 
547 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  24.63 
 
 
547 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.62 
 
 
529 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  27.22 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.83 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.23 
 
 
539 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  26.02 
 
 
527 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  24.27 
 
 
496 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.84 
 
 
539 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  22.86 
 
 
539 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  21.93 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  29.47 
 
 
476 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.55 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  27.15 
 
 
502 aa  87.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  28.46 
 
 
627 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.31 
 
 
529 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>