135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3801 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  100 
 
 		 529 aa  1091    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  35.03 
 
 		 539 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  35.2 
 
 		 521 aa  299  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  35.6 
 
 		 536 aa  294  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  35.45 
 
 		 529 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  37.05 
 
 		 524 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.73 
 
 		 525 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.98 
 
 		 575 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.4 
 
 		 526 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  34.33 
 
 		 641 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.83 
 
 		 525 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  33.66 
 
 		 540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  33.97 
 
 		 545 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  33.66 
 
 		 542 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  34.09 
 
 		 538 aa  272  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  32.5 
 
 		 543 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.28 
 
 		 530 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 562 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.09 
 
 		 530 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 534 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.99 
 
 		 534 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  33.14 
 
 		 542 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.8 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.81 
 
 		 539 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  33.71 
 
 		 550 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.59 
 
 		 506 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  31.29 
 
 		 559 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.64 
 
 		 575 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.44 
 
 		 551 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.42 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.27 
 
 		 575 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.27 
 
 		 575 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.93 
 
 		 560 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  28.89 
 
 		 565 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.29 
 
 		 560 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.59 
 
 		 570 aa  239  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.13 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.11 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  30.58 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 547 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.64 
 
 		 507 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  34.16 
 
 		 627 aa  227  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  32.51 
 
 		 553 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  33.48 
 
 		 476 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  35.28 
 
 		 560 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  32.07 
 
 		 506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  29.13 
 
 		 574 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.11 
 
 		 556 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  31.33 
 
 		 506 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.15 
 
 		 560 aa  210  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  31.31 
 
 		 559 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.74 
 
 		 559 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.75 
 
 		 559 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.25 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.18 
 
 		 571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  30.36 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.07 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  22.89 
 
 		 543 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.44 
 
 		 525 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  22.72 
 
 		 534 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  23.84 
 
 		 547 aa  99.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 525 aa  98.2  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.64 
 
 		 518 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.21 
 
 		 529 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  23.06 
 
 		 540 aa  90.1  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.81 
 
 		 374 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  24.31 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.31 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  26.37 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  23.59 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.59 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  22.92 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.19 
 
 		 539 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  20.62 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.88 
 
 		 540 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  23.75 
 
 		 539 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  24.43 
 
 		 527 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.45 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.77 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.39 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  23.29 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  22.46 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  21.8 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  23.3 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  22.63 
 
 		 496 aa  67  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  21.87 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  22.56 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0847  PepSY-associated TM helix  25.72 
 
 		 505 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.73 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  22.39 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  23.16 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  24.05 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  23.16 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  23.16 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  23.22 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  21.89 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  21.71 
 
 		 444 aa  54.7  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2394  PepSY-associated TM helix  23.04 
 
 		 393 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  21.04 
 
 		 351 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>