239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1573 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 351 aa  718    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  27.47 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  22.8 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.86 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  22.97 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2723  putative iron-regulated membrane protein  22.71 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  25.7 
 
 		 366 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.12 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  25 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.38 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  24.52 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  22.82 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  24.86 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  22.75 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.66 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.54 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.05 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.93 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.25 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  23.14 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.85 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  25.28 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.07 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.58 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  23.31 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  25.27 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.42 
 
 		 410 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  24.73 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  24.32 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  22.58 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  24.59 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  24.59 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  22.38 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  24.17 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  23.1 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  21.94 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  22.78 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  23.98 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  24.38 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  24.38 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  23.68 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  25 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  22.46 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  25.96 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  23.17 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  23.35 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.73 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  25.69 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  23.17 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  25.76 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  26.46 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  24.38 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  22.56 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  25.47 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  23.17 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  34.55 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  27.91 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.8 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  21.61 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  35.48 
 
 		 471 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  21.58 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  24.8 
 
 		 538 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  23.06 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3894  PepSY-associated TM helix domain protein  29.17 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  23.55 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  22.82 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  21.88 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  22.92 
 
 		 504 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.21 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  28.33 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  20.4 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  25.78 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.37 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  23.87 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.27 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  27.1 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.53 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.91 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.48 
 
 		 718 aa  67.4  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.01 
 
 		 844 aa  67  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 530 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.68 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2069  PepSY-associated TM helix domain protein  24.73 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  20.6 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  20.85 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.85 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.27 
 
 		 843 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1877  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.93 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.05 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.91 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.47 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  23.01 
 
 		 840 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3008  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.54 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  22.73 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2399  Uncharacterized iron-regulated membrane protein-like protein  22.54 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  27.49 
 
 		 451 aa  62.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.66 
 
 		 842 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.61 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.43 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>