144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1911 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  880    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  59.67 
 
 
432 aa  520  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1822  hypothetical protein  32.11 
 
 
427 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  27.79 
 
 
439 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  28.6 
 
 
433 aa  156  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  28.64 
 
 
430 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  28.22 
 
 
433 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.73 
 
 
433 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.3 
 
 
409 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  25.47 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.22 
 
 
403 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  29.91 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  26.26 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  26.09 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3317  PepSY-associated TM helix domain protein  27.29 
 
 
446 aa  127  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00586385 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.2 
 
 
412 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  25.99 
 
 
408 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.06 
 
 
412 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.94 
 
 
412 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  26.44 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  27.34 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.41 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32750  hypothetical protein  27.99 
 
 
382 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196352  hitchhiker  0.0000232684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  25.55 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  23.54 
 
 
405 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  25.41 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  23.77 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  26.96 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  23.85 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  23.68 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  24.31 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.59 
 
 
842 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  31.14 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  22.89 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  22.91 
 
 
850 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  24.03 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  25.88 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  26 
 
 
850 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  22.36 
 
 
850 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  22.42 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  23.08 
 
 
461 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  29.71 
 
 
504 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.78 
 
 
849 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.24 
 
 
425 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.33 
 
 
850 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  26.5 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.81 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  23.5 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.11 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  25.27 
 
 
451 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.92 
 
 
369 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.58 
 
 
851 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.44 
 
 
844 aa  61.6  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  27.49 
 
 
489 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  26.38 
 
 
381 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.91 
 
 
840 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  30.05 
 
 
370 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  27.49 
 
 
491 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.62 
 
 
459 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  27.33 
 
 
783 aa  60.1  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.58 
 
 
382 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.48 
 
 
405 aa  59.7  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  24.68 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  23.88 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.28 
 
 
512 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  20.91 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  24.79 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  22.02 
 
 
484 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  23.51 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  30.26 
 
 
490 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.65 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  26.37 
 
 
454 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  26.61 
 
 
487 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.13 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  27.45 
 
 
469 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  25.82 
 
 
457 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  24.73 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  27.62 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  25.27 
 
 
455 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  25.27 
 
 
455 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  23.67 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  27.97 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.91 
 
 
486 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  23 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  21.56 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  23 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  26.86 
 
 
822 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  24.01 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.78 
 
 
739 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.78 
 
 
739 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  26.78 
 
 
398 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  24.08 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  28.99 
 
 
479 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2260  iron-regulated membrane protein-like protein  27.78 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  24.86 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.12 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.66 
 
 
560 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.68 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  27.45 
 
 
474 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  20.33 
 
 
470 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>